More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1517 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  100 
 
 
325 aa  658    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  77.16 
 
 
491 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  67.5 
 
 
328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  70.64 
 
 
329 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  67.1 
 
 
317 aa  434  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  65.34 
 
 
335 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  68.04 
 
 
324 aa  434  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  67.21 
 
 
329 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  67.99 
 
 
328 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  68.22 
 
 
328 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  64.02 
 
 
328 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  65.65 
 
 
330 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  64.4 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  68.22 
 
 
328 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
331 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  61.4 
 
 
330 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
327 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  61.4 
 
 
330 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  67.91 
 
 
328 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  66.12 
 
 
332 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  64.33 
 
 
328 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  63.61 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.02 
 
 
331 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  58.79 
 
 
330 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  63.29 
 
 
340 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  66.04 
 
 
334 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  64.35 
 
 
334 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  63.72 
 
 
449 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  64.29 
 
 
309 aa  391  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  67.09 
 
 
324 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  59.82 
 
 
331 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  58.48 
 
 
331 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  57.58 
 
 
331 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  60.74 
 
 
330 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  57.49 
 
 
331 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  61.16 
 
 
326 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  61.7 
 
 
326 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  62.73 
 
 
330 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  58.28 
 
 
331 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  61.28 
 
 
329 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  62.03 
 
 
330 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  61.28 
 
 
329 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  62.07 
 
 
328 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  64.01 
 
 
330 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  63.35 
 
 
338 aa  360  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  59.61 
 
 
325 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  58.28 
 
 
332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  53.29 
 
 
326 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  59.2 
 
 
328 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  57.19 
 
 
338 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  60 
 
 
330 aa  346  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  58.23 
 
 
328 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  57.05 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  57.98 
 
 
325 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  54.4 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  53.37 
 
 
333 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  52.12 
 
 
328 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  55.31 
 
 
320 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  56.19 
 
 
326 aa  328  9e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  52.16 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  53.07 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  54.46 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  52.02 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  51.83 
 
 
360 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  50 
 
 
331 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  50.76 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  53.09 
 
 
331 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  54.98 
 
 
333 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
320 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  52.87 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  49.69 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.02 
 
 
329 aa  318  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.02 
 
 
329 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  52.02 
 
 
329 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  50.16 
 
 
329 aa  318  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  318  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  47.6 
 
 
336 aa  318  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  52.02 
 
 
329 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  51.4 
 
 
329 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
328 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
331 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
331 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  51.86 
 
 
328 aa  316  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
331 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  51.88 
 
 
327 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.62 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  48.76 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  54.11 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  53.44 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  50.78 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.96 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3748  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
317 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  53.51 
 
 
341 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  50.62 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  55.48 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  50.76 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
328 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>