More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4022 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  100 
 
 		 331 aa  678    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  66.16 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  67.79 
 
 		 340 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  65.86 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  65.86 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  64.65 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  64.05 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  65.53 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  63.88 
 
 		 331 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  62.57 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  65.48 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  63.02 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  63.24 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  63.64 
 
 		 329 aa  424  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  62.42 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  66.67 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  65.83 
 
 		 324 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  63.55 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  62.31 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  60.91 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  62.12 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  62.73 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  63.03 
 
 		 326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  61.52 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  61.16 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  62.16 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  60.3 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  63.03 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  60.06 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  64.09 
 
 		 329 aa  391  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  60 
 
 		 328 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  61.26 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  60 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  61.37 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  58.18 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  62.11 
 
 		 324 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  58.48 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  59.88 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  59.76 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  63.32 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  64.91 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  59.82 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  56.29 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  56.62 
 
 		 326 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  59.15 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  56.31 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  55.56 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  54.68 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  52.76 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  56.48 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  57.85 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  54.52 
 
 		 330 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  52.57 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  56 
 
 		 330 aa  335  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  55.45 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  51.22 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  48.79 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  50.76 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  49.08 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 331 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  56.44 
 
 		 328 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0669  aldo/keto reductase  54.52 
 
 		 333 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  53.52 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  49.24 
 
 		 339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  53.14 
 
 		 320 aa  319  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  52.11 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  48.94 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  53.35 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  47.76 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  49.24 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  52.47 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  52.01 
 
 		 327 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  51.75 
 
 		 341 aa  311  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  50 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  51.71 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  52.09 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  48.49 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  51.46 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3748  aldo/keto reductase  58.01 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  49.1 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  47.06 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  48.49 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  48.49 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  49.7 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  55.02 
 
 		 327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  48.92 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  52.9 
 
 		 325 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  48.19 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  48.93 
 
 		 331 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  50.63 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  48.63 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  49.7 
 
 		 331 aa  298  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  47.99 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  47.55 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  48.32 
 
 		 332 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  48.61 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  47.55 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  49.4 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>