More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3685 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  100 
 
 
331 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  74.55 
 
 
331 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  72.12 
 
 
332 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  69.7 
 
 
329 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  71.3 
 
 
331 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  69.09 
 
 
337 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  70 
 
 
330 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  69.18 
 
 
331 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  67.27 
 
 
332 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  70.96 
 
 
338 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
331 aa  431  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  66.37 
 
 
332 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
337 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
338 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
338 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
338 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  64.95 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  64.95 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  64.95 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  62.31 
 
 
332 aa  411  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  64.62 
 
 
353 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  60.86 
 
 
330 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  55.93 
 
 
330 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
331 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  52.66 
 
 
328 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
328 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  51.22 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  50.62 
 
 
328 aa  318  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
328 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  51.85 
 
 
328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  50.45 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
328 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  50 
 
 
327 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  50.62 
 
 
449 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  46.86 
 
 
333 aa  309  5e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
335 aa  308  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  52.76 
 
 
332 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  50.45 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
326 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  52.16 
 
 
328 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  48.9 
 
 
317 aa  299  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  47.88 
 
 
330 aa  299  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.55 
 
 
331 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
331 aa  298  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
326 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  48.94 
 
 
331 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
328 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  44.95 
 
 
328 aa  288  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
332 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  46.99 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  48.02 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
338 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  45.25 
 
 
323 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
329 aa  278  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  46.97 
 
 
334 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  48.63 
 
 
329 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  48.63 
 
 
329 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  44.98 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  45.32 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  45.4 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  46.52 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  46.46 
 
 
491 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
329 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  50 
 
 
324 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  45.37 
 
 
334 aa  268  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  43.25 
 
 
326 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  48.32 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  46.34 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  46.47 
 
 
328 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  47.48 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  47.49 
 
 
325 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  45.54 
 
 
333 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
327 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  46.46 
 
 
320 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  47.54 
 
 
309 aa  259  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
338 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  44.28 
 
 
339 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
327 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  43.47 
 
 
360 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  45.54 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  44.69 
 
 
324 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
331 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
333 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  45.73 
 
 
330 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
328 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  49.53 
 
 
330 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  42.04 
 
 
333 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  43.6 
 
 
331 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14600  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.77 
 
 
352 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  44.11 
 
 
342 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
331 aa  248  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>