More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4141 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  100 
 
 
323 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  77.4 
 
 
323 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
332 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
330 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  46.86 
 
 
329 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  47.02 
 
 
331 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
331 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  46.54 
 
 
331 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  44.94 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  47 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  49.17 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  49.49 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  49.17 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  44.89 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
331 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  45.4 
 
 
332 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  45.25 
 
 
331 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  47.87 
 
 
333 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  47.87 
 
 
333 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  47.87 
 
 
333 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  45.03 
 
 
337 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  48.81 
 
 
338 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
335 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
328 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  45.43 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  43.51 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  47.49 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  43.99 
 
 
328 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  44.16 
 
 
330 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
353 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
330 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  43.85 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
326 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  43.99 
 
 
328 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
331 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  44.87 
 
 
449 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  43.83 
 
 
326 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
329 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  43.39 
 
 
324 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  42.44 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  43.44 
 
 
331 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
340 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  43 
 
 
326 aa  255  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
338 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  44.75 
 
 
324 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
328 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  43.33 
 
 
309 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  42.16 
 
 
491 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  41.77 
 
 
329 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  41.37 
 
 
331 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  41.46 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
333 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
332 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  43.04 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
325 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  39.49 
 
 
330 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  42.14 
 
 
332 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.88 
 
 
331 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
333 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  42.35 
 
 
320 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
328 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  40.65 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  40.51 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  41.31 
 
 
325 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
325 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
327 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  39.6 
 
 
320 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  40.63 
 
 
328 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  41.34 
 
 
330 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
333 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  40.66 
 
 
328 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
336 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  38.18 
 
 
338 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
331 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
331 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
334 aa  225  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  39.46 
 
 
328 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.73 
 
 
327 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
331 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  39.68 
 
 
326 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  38.92 
 
 
333 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.85 
 
 
325 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
341 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  37.85 
 
 
331 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>