More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4243 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  100 
 
 
330 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  66.16 
 
 
331 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  62.38 
 
 
330 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  63 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  61.16 
 
 
332 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  63 
 
 
332 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  64.51 
 
 
337 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  64.24 
 
 
338 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  61.88 
 
 
331 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  59.94 
 
 
329 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  58.84 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  60.86 
 
 
331 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  63.08 
 
 
332 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  61.16 
 
 
338 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  61.16 
 
 
338 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
332 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  58.72 
 
 
337 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  58.1 
 
 
338 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  59.33 
 
 
333 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  59.33 
 
 
333 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  59.33 
 
 
333 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  59.01 
 
 
353 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  54.01 
 
 
330 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  50 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
328 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  50.8 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  51.37 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  48.62 
 
 
328 aa  305  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  51.56 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  50 
 
 
328 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
327 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  48.06 
 
 
335 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  50.77 
 
 
326 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
328 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
328 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  48.33 
 
 
328 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  50.62 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  42.44 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  45.08 
 
 
323 aa  281  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  46.39 
 
 
317 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  45.73 
 
 
326 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  47.08 
 
 
329 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  46.55 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  44.71 
 
 
331 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  47.87 
 
 
340 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  47.68 
 
 
324 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  45.15 
 
 
330 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  44.68 
 
 
330 aa  268  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
328 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  48.9 
 
 
334 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  46.44 
 
 
491 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
328 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
319 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  49.08 
 
 
320 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  44.71 
 
 
331 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
328 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  48.12 
 
 
324 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  45.43 
 
 
330 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.71 
 
 
331 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  44.07 
 
 
330 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  43.6 
 
 
331 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  47.91 
 
 
332 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  44.85 
 
 
331 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  46.48 
 
 
328 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
331 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  44.04 
 
 
331 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  46.81 
 
 
329 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  43.64 
 
 
331 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  49.07 
 
 
324 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  46.2 
 
 
329 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  48.31 
 
 
329 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  48.15 
 
 
325 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  43.2 
 
 
330 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  50 
 
 
338 aa  255  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  46.04 
 
 
330 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  43.56 
 
 
329 aa  255  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.69 
 
 
327 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  43.25 
 
 
334 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  48.78 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  45.95 
 
 
309 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  44.72 
 
 
327 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
326 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0669  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
333 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
335 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
330 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  45.26 
 
 
328 aa  249  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
327 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  44.34 
 
 
328 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  44.58 
 
 
331 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
327 aa  248  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.48 
 
 
328 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
327 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
327 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>