More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4260 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  100 
 
 
327 aa  661    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  69.09 
 
 
330 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  68.36 
 
 
335 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  69.25 
 
 
329 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  65.45 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  66.67 
 
 
327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  66.67 
 
 
334 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  68.32 
 
 
329 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
334 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  65.45 
 
 
331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  67.98 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  66.97 
 
 
327 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  66.36 
 
 
329 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  67.98 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  65.27 
 
 
334 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  66.26 
 
 
335 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  67.37 
 
 
329 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  66.47 
 
 
329 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  67.28 
 
 
327 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  65.26 
 
 
329 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  69.18 
 
 
330 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  64.65 
 
 
329 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  64.65 
 
 
329 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  64.65 
 
 
329 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
327 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  65.56 
 
 
329 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  64.97 
 
 
334 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  68.18 
 
 
325 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  65.44 
 
 
327 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  64.65 
 
 
328 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.29 
 
 
327 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  62.24 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  63.86 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  66.25 
 
 
325 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  63.36 
 
 
329 aa  407  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  63.35 
 
 
327 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  64.33 
 
 
344 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  61.63 
 
 
327 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  60.55 
 
 
333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  62.05 
 
 
331 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  60.73 
 
 
326 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  60.84 
 
 
331 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  60.37 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  61.33 
 
 
328 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  59.82 
 
 
327 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  60.73 
 
 
328 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  60.49 
 
 
342 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  61.8 
 
 
321 aa  388  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  60.18 
 
 
328 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  59.44 
 
 
328 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  59.44 
 
 
331 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6149  aldo/keto reductase  60.19 
 
 
330 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
333 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  56.92 
 
 
401 aa  359  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0842  aldo/keto reductase  57.63 
 
 
390 aa  358  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495708  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  56.71 
 
 
382 aa  352  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3904  twin-arginine translocation pathway signal  55.45 
 
 
385 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307988  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3243  aldo/keto reductase  55.79 
 
 
388 aa  351  8.999999999999999e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1802  aldo/keto reductase  55.28 
 
 
372 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.246141  normal  0.022853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3215  aldo/keto reductase  54.1 
 
 
384 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32550  Aldo/keto reductase protein  54.71 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  53.94 
 
 
390 aa  342  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  52.38 
 
 
331 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  53.42 
 
 
328 aa  338  9e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  52.87 
 
 
330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4369  aldo/keto reductase  61.15 
 
 
363 aa  335  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2146  aldo/keto reductase  52.94 
 
 
405 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  51.2 
 
 
333 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  51.37 
 
 
326 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  51.35 
 
 
329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  53.17 
 
 
330 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  55.59 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  52.63 
 
 
324 aa  318  6e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
328 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  51.99 
 
 
328 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
328 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
331 aa  316  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  52.8 
 
 
325 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  51.51 
 
 
328 aa  315  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
325 aa  315  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  48.49 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  50.15 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  52.17 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  49.55 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  54.27 
 
 
324 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  55.59 
 
 
330 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  50 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
328 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
326 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  51.52 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  55.16 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  47.85 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  52.92 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  47.99 
 
 
317 aa  302  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  47.55 
 
 
330 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>