More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0842 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0842  aldo/keto reductase  100 
 
 
390 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495708  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1802  aldo/keto reductase  63.73 
 
 
372 aa  474  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.246141  normal  0.022853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  61.23 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  60.38 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  56.42 
 
 
382 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  61.44 
 
 
331 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  62.93 
 
 
329 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  58.9 
 
 
335 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  62.19 
 
 
329 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  61.88 
 
 
329 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
335 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  58.93 
 
 
329 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  58.51 
 
 
333 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  61.06 
 
 
331 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  57.99 
 
 
328 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  58.95 
 
 
334 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  57.81 
 
 
330 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  59.43 
 
 
325 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  59.12 
 
 
327 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  57.72 
 
 
334 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  57.99 
 
 
329 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  58.33 
 
 
334 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  60.94 
 
 
329 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.94 
 
 
329 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.94 
 
 
329 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  57.99 
 
 
328 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  59.06 
 
 
329 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  58.26 
 
 
331 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.82 
 
 
329 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  59.38 
 
 
329 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
328 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.26 
 
 
327 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.79 
 
 
334 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  58.18 
 
 
327 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  56.11 
 
 
327 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  50.13 
 
 
401 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  56.02 
 
 
331 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  58.44 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  61.25 
 
 
330 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  58.49 
 
 
327 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
325 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6149  aldo/keto reductase  55.79 
 
 
330 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3243  aldo/keto reductase  56.29 
 
 
388 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  55.79 
 
 
327 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  56.87 
 
 
342 aa  359  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  57.63 
 
 
327 aa  358  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2146  aldo/keto reductase  51.2 
 
 
405 aa  358  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3215  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
384 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  54.98 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3904  twin-arginine translocation pathway signal  50.55 
 
 
385 aa  355  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307988  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  52.89 
 
 
328 aa  355  1e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  54.86 
 
 
326 aa  352  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
331 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  56.21 
 
 
344 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  49.18 
 
 
390 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32550  Aldo/keto reductase protein  51.3 
 
 
415 aa  345  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  54.04 
 
 
321 aa  345  7e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  54.23 
 
 
328 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  52.98 
 
 
327 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  55.28 
 
 
331 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  53.44 
 
 
328 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4369  aldo/keto reductase  53.23 
 
 
363 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  52.58 
 
 
331 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  48.1 
 
 
325 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  51.8 
 
 
324 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  52.78 
 
 
333 aa  319  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  50.49 
 
 
326 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  50.77 
 
 
333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  48.12 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  52.82 
 
 
325 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
328 aa  305  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  50.82 
 
 
326 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  50.49 
 
 
328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  52.32 
 
 
328 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
340 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  49.19 
 
 
328 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  50.93 
 
 
330 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
328 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  48.62 
 
 
335 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  51.47 
 
 
328 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
328 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  48.76 
 
 
330 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  47.2 
 
 
331 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  49.51 
 
 
331 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
324 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  49.68 
 
 
331 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  48.53 
 
 
330 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  47.9 
 
 
317 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  48.5 
 
 
325 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  50.65 
 
 
329 aa  292  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  48.54 
 
 
330 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  47.83 
 
 
331 aa  292  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
332 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  48.22 
 
 
330 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  48.44 
 
 
327 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
328 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.49 
 
 
325 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  48.91 
 
 
331 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  51.48 
 
 
324 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>