More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3243 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3904  twin-arginine translocation pathway signal  80.67 
 
 
385 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307988  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3243  aldo/keto reductase  100 
 
 
388 aa  786    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3215  aldo/keto reductase  74.87 
 
 
384 aa  587  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2146  aldo/keto reductase  56.7 
 
 
405 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32550  Aldo/keto reductase protein  58.94 
 
 
415 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  60.55 
 
 
329 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  58.01 
 
 
330 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
329 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  58.18 
 
 
331 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  59.1 
 
 
335 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  57.82 
 
 
401 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  57.06 
 
 
329 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  59.01 
 
 
333 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  60.18 
 
 
330 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  58.2 
 
 
334 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  58.99 
 
 
325 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.36 
 
 
329 aa  362  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  57.36 
 
 
329 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.36 
 
 
329 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0842  aldo/keto reductase  53.74 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495708  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  57.28 
 
 
327 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  51.07 
 
 
382 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  57.23 
 
 
327 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  56.53 
 
 
329 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  56.13 
 
 
335 aa  359  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  56.75 
 
 
329 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  57.85 
 
 
329 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  57.94 
 
 
327 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  58.57 
 
 
331 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  55.79 
 
 
327 aa  352  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  55.32 
 
 
329 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.11 
 
 
329 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4369  aldo/keto reductase  57.45 
 
 
363 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
327 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  56.21 
 
 
331 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  54.8 
 
 
328 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.62 
 
 
328 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  55.66 
 
 
342 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  54.77 
 
 
329 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  56.39 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1802  aldo/keto reductase  49.86 
 
 
372 aa  342  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.246141  normal  0.022853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  54.77 
 
 
328 aa  342  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  53.52 
 
 
334 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
331 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  53.8 
 
 
334 aa  338  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  54.06 
 
 
328 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6149  aldo/keto reductase  55.52 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  53.8 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.1 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
329 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  53.73 
 
 
331 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  53.12 
 
 
327 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  56.83 
 
 
325 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  52.91 
 
 
331 aa  332  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.21 
 
 
334 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  52.96 
 
 
326 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  53.42 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  47.63 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  53.27 
 
 
321 aa  326  5e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  51.22 
 
 
328 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  52.88 
 
 
327 aa  318  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  51.09 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  49.23 
 
 
328 aa  311  9e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  47.02 
 
 
325 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  47.45 
 
 
331 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  46.83 
 
 
326 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  46.55 
 
 
330 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  46.85 
 
 
333 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
333 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1160  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
382 aa  279  5e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0226313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  47.55 
 
 
326 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  48.6 
 
 
330 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
330 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  47.02 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  45.81 
 
 
335 aa  269  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  49.34 
 
 
328 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  50.17 
 
 
325 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  47.11 
 
 
328 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  43.94 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.88 
 
 
331 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  43.44 
 
 
329 aa  266  5.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  47.1 
 
 
331 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  47.73 
 
 
325 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  45.62 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  45.68 
 
 
328 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  47.47 
 
 
331 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  49.83 
 
 
325 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  47.34 
 
 
324 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  45.17 
 
 
331 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  46.8 
 
 
330 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  46.06 
 
 
328 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  46.71 
 
 
328 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  45.34 
 
 
491 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  43.69 
 
 
329 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  47.08 
 
 
330 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  45.25 
 
 
340 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  45.76 
 
 
309 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  47.08 
 
 
327 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>