More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4035 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  100 
 
 
338 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  99.11 
 
 
338 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  93.69 
 
 
333 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  93.69 
 
 
333 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  93.69 
 
 
333 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  89.91 
 
 
338 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  87.54 
 
 
337 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  69.72 
 
 
337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  69.7 
 
 
331 aa  461  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  66.97 
 
 
329 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  69.09 
 
 
332 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  69.28 
 
 
332 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  66.97 
 
 
332 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
331 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  68.56 
 
 
338 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
331 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  66.36 
 
 
330 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
331 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  64.13 
 
 
332 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  64.92 
 
 
353 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  61.16 
 
 
330 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  59.15 
 
 
330 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  53.99 
 
 
331 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  54.27 
 
 
328 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  52.44 
 
 
328 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  54.87 
 
 
324 aa  330  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  54.88 
 
 
327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  54.26 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  52.78 
 
 
328 aa  326  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  52.74 
 
 
328 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  52.12 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  51.36 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  53.12 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  51.96 
 
 
330 aa  319  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  54.6 
 
 
340 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
331 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  53.66 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  53.38 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  51.66 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  51.64 
 
 
335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  51.22 
 
 
328 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  51.86 
 
 
332 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  47.59 
 
 
333 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  53.35 
 
 
328 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  51.38 
 
 
331 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.06 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  53.23 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
331 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  49.55 
 
 
334 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  49.53 
 
 
317 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  48.8 
 
 
331 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
326 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  47.8 
 
 
323 aa  292  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
338 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  51.38 
 
 
320 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  46.5 
 
 
331 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
328 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
324 aa  288  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  47.96 
 
 
334 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  45.62 
 
 
323 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  50.46 
 
 
329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  53.27 
 
 
329 aa  282  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  51.1 
 
 
491 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  48.92 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  44.95 
 
 
328 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  50.98 
 
 
325 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  49.85 
 
 
329 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  48.78 
 
 
330 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
331 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  50.6 
 
 
328 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  51.98 
 
 
324 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  47.72 
 
 
328 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  47.42 
 
 
331 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  50 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  46.18 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  45.02 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  49.08 
 
 
330 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
329 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  47.85 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  46.48 
 
 
328 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
333 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  47.89 
 
 
330 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  46.32 
 
 
334 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  49.5 
 
 
328 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.59 
 
 
327 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  48.19 
 
 
331 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  53.21 
 
 
330 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  46.82 
 
 
325 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  47.77 
 
 
328 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
329 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  47.42 
 
 
327 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  46.44 
 
 
331 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  44.82 
 
 
331 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  48.52 
 
 
309 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  47.4 
 
 
329 aa  258  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.71 
 
 
325 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>