More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3784 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  100 
 
 
353 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  66.06 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  66.67 
 
 
329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  67.07 
 
 
337 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  64.05 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  66.46 
 
 
332 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  65.86 
 
 
331 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  65.26 
 
 
331 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  65.97 
 
 
338 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  65.76 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  64.55 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  62.24 
 
 
331 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  64.55 
 
 
338 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  63.66 
 
 
332 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  65.15 
 
 
333 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  65.15 
 
 
333 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  64.55 
 
 
337 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  65.15 
 
 
333 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  64.55 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  63.44 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  64.24 
 
 
338 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  58.72 
 
 
330 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  57.23 
 
 
330 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  51.1 
 
 
328 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  48.01 
 
 
328 aa  301  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
328 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  52.04 
 
 
328 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  51.4 
 
 
326 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  49.53 
 
 
449 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
329 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  48.78 
 
 
328 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
327 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
324 aa  292  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  48.06 
 
 
335 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
340 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  47.43 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  45.32 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  51.1 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.13 
 
 
331 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  47.34 
 
 
317 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
328 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  46.5 
 
 
331 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
332 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  47.34 
 
 
332 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  44.98 
 
 
331 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  44.71 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  45.73 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  48.51 
 
 
328 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
323 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  45.99 
 
 
331 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  47.04 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  44.16 
 
 
323 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
329 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
333 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  45.73 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
330 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
330 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  48.59 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  47.24 
 
 
334 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  45.18 
 
 
331 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  43.5 
 
 
331 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  48.81 
 
 
334 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  45.26 
 
 
491 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  46.67 
 
 
328 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  49.66 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  47.94 
 
 
338 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
328 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  45.29 
 
 
329 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
328 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
328 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
324 aa  255  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  43.69 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  44.07 
 
 
331 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  44.98 
 
 
329 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
327 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  46.54 
 
 
328 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  46.08 
 
 
330 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
331 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  44.13 
 
 
326 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  45.57 
 
 
330 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  46.34 
 
 
320 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  44.2 
 
 
325 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  43.98 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  44.83 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  44.95 
 
 
328 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
360 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  42.64 
 
 
333 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  49.03 
 
 
330 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  43.47 
 
 
324 aa  235  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  42.2 
 
 
334 aa  235  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  44.34 
 
 
309 aa  235  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  50.33 
 
 
327 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.9 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>