More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5816 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  100 
 
 
332 aa  668    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  65.85 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  65.24 
 
 
331 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  63.38 
 
 
331 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  65.23 
 
 
329 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  64.31 
 
 
332 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  66.16 
 
 
332 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  67.07 
 
 
337 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  64.13 
 
 
338 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  65.85 
 
 
332 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  64.13 
 
 
338 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  64.72 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  64.72 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  64.72 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  62.31 
 
 
331 aa  411  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  62.61 
 
 
338 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  62.77 
 
 
331 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  60.86 
 
 
331 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  63.53 
 
 
337 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  63.94 
 
 
353 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  63.08 
 
 
330 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  55.18 
 
 
330 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  55.28 
 
 
449 aa  342  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  53.25 
 
 
331 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  54.58 
 
 
324 aa  330  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
327 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  52.98 
 
 
328 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  51.23 
 
 
328 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  51.42 
 
 
317 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
328 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  49.08 
 
 
328 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  53.61 
 
 
326 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  52.2 
 
 
324 aa  315  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  48.47 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  48.49 
 
 
335 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  50 
 
 
340 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  51.1 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
328 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  52.91 
 
 
324 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  47.72 
 
 
330 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  47.42 
 
 
330 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  46.65 
 
 
330 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  48.45 
 
 
329 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
332 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
332 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  47.11 
 
 
331 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  46.06 
 
 
331 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  50.45 
 
 
334 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  47.88 
 
 
334 aa  288  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  43.89 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  51.56 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.77 
 
 
331 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  45.2 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  44.89 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  48.85 
 
 
309 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  46.5 
 
 
331 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  49.21 
 
 
491 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  44.75 
 
 
331 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  50 
 
 
329 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  48.46 
 
 
326 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  46.32 
 
 
328 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
331 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  50.84 
 
 
325 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  50 
 
 
329 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  48.78 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  46.91 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  44.04 
 
 
333 aa  272  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  46.87 
 
 
328 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  45.26 
 
 
330 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
320 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  48.01 
 
 
338 aa  268  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  42.02 
 
 
331 aa  268  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  44.17 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  44.84 
 
 
326 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  46.67 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
328 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  46.63 
 
 
324 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  45.15 
 
 
330 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  44.65 
 
 
334 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
335 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  42.51 
 
 
334 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
331 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  46.23 
 
 
328 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  43.77 
 
 
333 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
331 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  45.57 
 
 
330 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  43.6 
 
 
331 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.34 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  44.31 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
327 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  45.17 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  44.04 
 
 
360 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>