More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6178 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  100 
 
 
323 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  77.4 
 
 
323 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  48.45 
 
 
332 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  46.67 
 
 
330 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
332 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  46.11 
 
 
331 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  44.14 
 
 
329 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  46.73 
 
 
338 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
332 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  48.3 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  45.14 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  45.08 
 
 
330 aa  281  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
331 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  46.41 
 
 
338 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  45.57 
 
 
328 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  46.41 
 
 
338 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
331 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  45.89 
 
 
331 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
330 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  46.58 
 
 
338 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
330 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  46.1 
 
 
324 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  45.4 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  44.86 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
335 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
333 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
333 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
333 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
317 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  45.08 
 
 
337 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  44.16 
 
 
353 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  45.85 
 
 
337 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
330 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  44.03 
 
 
328 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
330 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
326 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
331 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  44.16 
 
 
326 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  44.07 
 
 
324 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  43.09 
 
 
327 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  42.19 
 
 
328 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  44 
 
 
329 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  44 
 
 
328 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
340 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  42.59 
 
 
331 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
338 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  43 
 
 
325 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  43.59 
 
 
449 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
334 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
328 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  40.58 
 
 
330 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
332 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
333 aa  245  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  44.07 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  41.42 
 
 
491 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  43.33 
 
 
309 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  42.09 
 
 
329 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  42.41 
 
 
329 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  43.26 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  40.39 
 
 
326 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
330 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
331 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  38.83 
 
 
333 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
328 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  40.75 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
330 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
325 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  42.39 
 
 
329 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
328 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.62 
 
 
331 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
338 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
328 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.81 
 
 
327 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
330 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  39.66 
 
 
320 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
334 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
320 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
328 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  40.32 
 
 
320 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
327 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  40.45 
 
 
328 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
331 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
329 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.12 
 
 
329 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  40.5 
 
 
329 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.12 
 
 
329 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.12 
 
 
329 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
330 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  40.63 
 
 
324 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  40 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  41.14 
 
 
329 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>