More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2625 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  100 
 
 
327 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  70.12 
 
 
328 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  55.14 
 
 
330 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  53.78 
 
 
331 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  52.41 
 
 
331 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  54.18 
 
 
328 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  53.94 
 
 
330 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  54.63 
 
 
330 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  52.15 
 
 
328 aa  344  8.999999999999999e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  52.66 
 
 
326 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  52.78 
 
 
330 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  53.17 
 
 
326 aa  339  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  52.29 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
326 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  52.92 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  53.29 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  52.74 
 
 
328 aa  335  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  52.65 
 
 
331 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  52.74 
 
 
328 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  51.24 
 
 
330 aa  332  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  52.34 
 
 
324 aa  332  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  51.35 
 
 
331 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  53.7 
 
 
333 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  52.52 
 
 
328 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  51.64 
 
 
335 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
328 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  52.35 
 
 
329 aa  324  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
327 aa  322  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.02 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
331 aa  319  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  48.33 
 
 
329 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.33 
 
 
329 aa  318  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
317 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.33 
 
 
329 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
333 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  51.71 
 
 
328 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  48.17 
 
 
331 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
330 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
328 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  51.75 
 
 
491 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  50 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
328 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  50.79 
 
 
449 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  47.4 
 
 
328 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
328 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  47.11 
 
 
329 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  46.81 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.85 
 
 
331 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
328 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  50.78 
 
 
325 aa  309  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
340 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  52.06 
 
 
326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  48.02 
 
 
329 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  48.6 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.33 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  47.16 
 
 
335 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  46.5 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  50 
 
 
328 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  48.9 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
338 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
332 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  46.5 
 
 
327 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.79 
 
 
328 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  48.5 
 
 
332 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
331 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  47.22 
 
 
327 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
327 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  50.93 
 
 
334 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  47.56 
 
 
342 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  47.58 
 
 
331 aa  299  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  47.09 
 
 
327 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
360 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
331 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  50.3 
 
 
325 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  46.46 
 
 
322 aa  295  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  46.57 
 
 
334 aa  295  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  48.63 
 
 
325 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
338 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  48.64 
 
 
331 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  46.97 
 
 
328 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
334 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  44.95 
 
 
328 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
327 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  46.15 
 
 
334 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  46.99 
 
 
334 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  46.82 
 
 
334 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  45.96 
 
 
335 aa  289  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  46.11 
 
 
327 aa  289  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  48.73 
 
 
320 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  44.86 
 
 
327 aa  288  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  46.37 
 
 
327 aa  288  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  44.21 
 
 
328 aa  288  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  47.13 
 
 
331 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  44.98 
 
 
328 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  48.14 
 
 
329 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  45.17 
 
 
327 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>