More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5425 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  100 
 
 
330 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  73.33 
 
 
330 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  56.88 
 
 
333 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
328 aa  361  8e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  47.87 
 
 
327 aa  309  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  46.23 
 
 
331 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  45.99 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  45.54 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  44.04 
 
 
331 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
319 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
319 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
319 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
328 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  41.37 
 
 
327 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
319 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  39.6 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  34.97 
 
 
319 aa  208  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
306 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  34.97 
 
 
312 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  37.29 
 
 
342 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  38.39 
 
 
329 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  37.22 
 
 
317 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  39.1 
 
 
329 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  39.42 
 
 
329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  33.53 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.09 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  33.54 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
332 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  35.98 
 
 
319 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  37.12 
 
 
352 aa  193  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
311 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  34.69 
 
 
334 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  37.09 
 
 
332 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  35.29 
 
 
319 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
349 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  34.43 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
333 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  31.89 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  37.83 
 
 
349 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  35.31 
 
 
332 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  35.74 
 
 
326 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  34.33 
 
 
332 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  33.43 
 
 
347 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  33.93 
 
 
331 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
319 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
332 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  32.1 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
314 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  32.01 
 
 
327 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  35.96 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  35.96 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  32.9 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.96 
 
 
326 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
335 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  33.94 
 
 
316 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  35.65 
 
 
326 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.65 
 
 
326 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  33.83 
 
 
334 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
359 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.72 
 
 
332 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  34.36 
 
 
355 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  33.94 
 
 
317 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.02 
 
 
311 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
336 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.02 
 
 
311 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.65 
 
 
326 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  32.93 
 
 
334 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  32.25 
 
 
329 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.02 
 
 
311 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  32.13 
 
 
336 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  36.39 
 
 
349 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.33 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.35 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  33.73 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.4 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  34.78 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.4 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  34.06 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.4 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  32.64 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  34.02 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  35.8 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.4 
 
 
311 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  31.71 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  32.83 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  32.25 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
329 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
328 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  32.42 
 
 
315 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
322 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.64 
 
 
327 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>