More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0687 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  100 
 
 		 319 aa  653    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  80.65 
 
 		 312 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  72.1 
 
 		 319 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  71.29 
 
 		 319 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  71.66 
 
 		 316 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  68.65 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  68.14 
 
 		 324 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  61.27 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  68.75 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  48.17 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  49.05 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  50 
 
 		 349 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  39.75 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  41.16 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  40.81 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  40.06 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  39.12 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  36.36 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  37.66 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  36.22 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  37.71 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  37.66 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  37.97 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  37.97 
 
 		 319 aa  202  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  34.81 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  37.22 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  37.22 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  33.94 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  37.37 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  32.61 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  37.29 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  38.59 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  33.55 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  37.04 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  37.77 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  33 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  35.53 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  32.06 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  36.75 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.45 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  35.58 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.53 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  36.54 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  35.89 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  34.74 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  36.22 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  35.46 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  36.46 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  33.87 
 
 		 329 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  33.87 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  35.22 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  35.87 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  34.62 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  32.36 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  31.27 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  35.28 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  35 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  36.26 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.54 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  33.65 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  33.75 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.11413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  33.54 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  34.31 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  33.54 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.45 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  34.73 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  33.98 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  29.35 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  33.11 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.23 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  33.12 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.54 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  33.77 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  34.49 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.69 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.23 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2012  aryl-alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.48 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  34.29 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  34.42 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  33.12 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  34.35 
 
 		 334 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  32.14 
 
 		 314 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  32.91 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.51 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.12 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  33.86 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.12 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  34.29 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.12 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>