53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3662 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  69.59 
 
 		 194 aa  287  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  65.98 
 
 		 194 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  61.38 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  60.32 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  54.76 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  55.38 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  54.87 
 
 		 196 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  49.09 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  52.58 
 
 		 193 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  51.32 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  49.52 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  46.91 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  47.12 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  46.84 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  45.26 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  45.79 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  43.68 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  43.68 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  44.74 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  43.16 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  41.58 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  33.15 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  40.22 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  38.59 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  39.66 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  34.97 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  38.86 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  32.97 
 
 		 196 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  33.88 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  34.07 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  34.07 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  34.07 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  34.78 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  36.52 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  36.31 
 
 		 200 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  34.83 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  35.75 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  34.64 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  35.87 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  35.56 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  35.75 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  32.4 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  32.58 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  35.88 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  37.09 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  35.92 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>