217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3576 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3576  Kup2 potassium uptake protein  100 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  75.86 
 
 		 633 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  87.07 
 
 		 633 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  70.71 
 
 		 633 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  58.65 
 
 		 630 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  68.69 
 
 		 633 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  55.86 
 
 		 632 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  53.15 
 
 		 632 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  62.65 
 
 		 634 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  49.55 
 
 		 633 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  53.98 
 
 		 652 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  48.62 
 
 		 640 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  46.43 
 
 		 633 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  53.12 
 
 		 651 aa  98.6  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  53.12 
 
 		 651 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  51.58 
 
 		 633 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  64.1 
 
 		 634 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  52.08 
 
 		 651 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  56.38 
 
 		 632 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  52.04 
 
 		 643 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  53.33 
 
 		 631 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  53.61 
 
 		 630 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  42.34 
 
 		 631 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  51.96 
 
 		 634 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  57.14 
 
 		 636 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  57.14 
 
 		 637 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  56.52 
 
 		 634 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  58.95 
 
 		 656 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  47.12 
 
 		 628 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  54.84 
 
 		 668 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  59.3 
 
 		 657 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  41.44 
 
 		 631 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  54.84 
 
 		 668 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  58.54 
 
 		 651 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  53.85 
 
 		 670 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  61.18 
 
 		 672 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  56.63 
 
 		 637 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  59.76 
 
 		 666 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  48.6 
 
 		 658 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  48.94 
 
 		 648 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  53.41 
 
 		 620 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  46 
 
 		 621 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  56.63 
 
 		 637 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  51.52 
 
 		 641 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  53.01 
 
 		 620 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  51.09 
 
 		 637 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  50 
 
 		 620 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  53.61 
 
 		 629 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  43.96 
 
 		 636 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  47.92 
 
 		 620 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  47.37 
 
 		 628 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  56.25 
 
 		 637 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  49.04 
 
 		 632 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  52.17 
 
 		 627 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4236  K potassium transporter  49.54 
 
 		 276 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  53.26 
 
 		 622 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  51.19 
 
 		 653 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  48.96 
 
 		 646 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  47.92 
 
 		 642 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  49.44 
 
 		 620 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  60 
 
 		 622 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  47.92 
 
 		 642 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  52.17 
 
 		 622 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  42 
 
 		 628 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4647  K potassium transporter  46.46 
 
 		 654 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  41.35 
 
 		 656 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  52.5 
 
 		 680 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  52.17 
 
 		 622 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5466  K potassium transporter  54.32 
 
 		 662 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0738492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  42.99 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  45.19 
 
 		 639 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  52.17 
 
 		 622 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  52.17 
 
 		 622 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  51.72 
 
 		 622 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  52.63 
 
 		 630 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  50.57 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  41 
 
 		 628 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  48.96 
 
 		 647 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  43.4 
 
 		 637 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  38.1 
 
 		 637 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  48.91 
 
 		 639 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  54.32 
 
 		 622 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  38.1 
 
 		 637 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  42 
 
 		 647 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  38.33 
 
 		 628 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  55.26 
 
 		 614 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  38.18 
 
 		 637 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>