273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3671 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  72.01 
 
 
614 aa  904    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  100 
 
 
618 aa  1242    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  60.07 
 
 
622 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  70.18 
 
 
616 aa  900    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  77.65 
 
 
635 aa  966    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  60.43 
 
 
622 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  55.83 
 
 
880 aa  623  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  53.95 
 
 
627 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  54.32 
 
 
627 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  55.65 
 
 
627 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  53.78 
 
 
886 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.84 
 
 
617 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.65 
 
 
570 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.25 
 
 
980 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  26.84 
 
 
888 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
1231 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.59 
 
 
544 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
591 aa  91.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
620 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.72 
 
 
586 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
1129 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.27 
 
 
730 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 
547 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
579 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  25.41 
 
 
712 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
1140 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  27.41 
 
 
624 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
1140 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.95 
 
 
716 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
772 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 
1140 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  27.1 
 
 
666 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.12 
 
 
514 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  22.57 
 
 
737 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  26.85 
 
 
726 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  27.59 
 
 
788 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  27.59 
 
 
788 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  26.37 
 
 
909 aa  75.5  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
650 aa  75.5  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.72 
 
 
730 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.94 
 
 
741 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  28.08 
 
 
729 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.97 
 
 
1099 aa  73.9  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  26.92 
 
 
778 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  25.62 
 
 
652 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  23.67 
 
 
672 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.67 
 
 
672 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.31 
 
 
633 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
610 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  23.68 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.29 
 
 
834 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.97 
 
 
811 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.41 
 
 
652 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.31 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.31 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.29 
 
 
831 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.8 
 
 
672 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.07 
 
 
822 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.55 
 
 
810 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.54 
 
 
794 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.31 
 
 
662 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.32 
 
 
804 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  25.58 
 
 
788 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.85 
 
 
1135 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.68 
 
 
659 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  24.25 
 
 
683 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  23.92 
 
 
707 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  23.94 
 
 
564 aa  69.7  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  23.64 
 
 
740 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.67 
 
 
930 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  21.58 
 
 
661 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  22.14 
 
 
665 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
917 aa  67.8  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2615  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.51 
 
 
641 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
476 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.76 
 
 
652 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
471 aa  64.3  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  22.49 
 
 
859 aa  63.9  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.4 
 
 
718 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0282  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.64 
 
 
341 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  26.1 
 
 
739 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
905 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
857 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  23.22 
 
 
659 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  26.69 
 
 
869 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  25.5 
 
 
749 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
1101 aa  61.6  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2832  cellulose synthase (UDP-forming)  27.62 
 
 
669 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
495 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 
752 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.65 
 
 
773 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
868 aa  60.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  23.94 
 
 
664 aa  60.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
773 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>