More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1594 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  58.14 
 
 		 1205 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  50.14 
 
 		 1231 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  54.72 
 
 		 1208 aa  726    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  48.45 
 
 		 1243 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  59.33 
 
 		 1203 aa  752    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  50.94 
 
 		 1226 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  67.17 
 
 		 1205 aa  855    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  57.08 
 
 		 1201 aa  737    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  55.47 
 
 		 1233 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  51.95 
 
 		 1200 aa  663    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  54.73 
 
 		 1179 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  55.45 
 
 		 1182 aa  705    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  52.29 
 
 		 1210 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  54.55 
 
 		 1200 aa  697    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  52.24 
 
 		 1238 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  53.82 
 
 		 1206 aa  724    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  55.56 
 
 		 1212 aa  733    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.55 
 
 		 1205 aa  688    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  53.6 
 
 		 1197 aa  686    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  71.54 
 
 		 677 aa  963    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  54.52 
 
 		 1204 aa  711    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  51.57 
 
 		 1209 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  54.12 
 
 		 1176 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  52.58 
 
 		 1183 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  58.94 
 
 		 1205 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  53.48 
 
 		 1183 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 663 aa  1327    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  57.94 
 
 		 1212 aa  687    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  58.3 
 
 		 1205 aa  730    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  67.17 
 
 		 1205 aa  855    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  62.56 
 
 		 1220 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  53.6 
 
 		 1228 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  51.37 
 
 		 1180 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  66.27 
 
 		 1234 aa  863    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  50.81 
 
 		 1203 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  58.3 
 
 		 1205 aa  730    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  53.88 
 
 		 1176 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  54.55 
 
 		 1209 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  61.72 
 
 		 1204 aa  760    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  67.17 
 
 		 1205 aa  855    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  56.33 
 
 		 1203 aa  722    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  54.05 
 
 		 1172 aa  679    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  51.75 
 
 		 1179 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  51.11 
 
 		 1201 aa  649    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.2 
 
 		 1179 aa  635  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  51.58 
 
 		 1197 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  47.63 
 
 		 1204 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  53.05 
 
 		 1162 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  47.01 
 
 		 1204 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  46.86 
 
 		 1204 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  47.95 
 
 		 1208 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  46.42 
 
 		 1207 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  49.78 
 
 		 1201 aa  595  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  47.01 
 
 		 1209 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  42.73 
 
 		 1822 aa  564  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  33.38 
 
 		 1241 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  54.21 
 
 		 1488 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1573  urea amidolyase related protein  46 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1574  Urea carboxylase  37.97 
 
 		 321 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.273828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  39.4 
 
 		 331 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  37.29 
 
 		 334 aa  169  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  37.74 
 
 		 331 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.77 
 
 		 343 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  37.91 
 
 		 325 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  37.38 
 
 		 325 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  38.36 
 
 		 331 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 		 323 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 		 323 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 		 323 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.5 
 
 		 334 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  37.5 
 
 		 334 aa  157  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.5 
 
 		 334 aa  157  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  37.83 
 
 		 334 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  37.83 
 
 		 334 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.83 
 
 		 334 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  37.83 
 
 		 334 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  37.42 
 
 		 335 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  37.54 
 
 		 324 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  36.86 
 
 		 323 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  36.89 
 
 		 324 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  37.79 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  36.04 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.25 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  35.64 
 
 		 325 aa  151  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  35.48 
 
 		 314 aa  148  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  38.21 
 
 		 338 aa  148  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  36.07 
 
 		 325 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  36.39 
 
 		 323 aa  147  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  34.52 
 
 		 314 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  34.67 
 
 		 310 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  39.06 
 
 		 282 aa  143  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  36.51 
 
 		 323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  32.63 
 
 		 329 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  35.12 
 
 		 310 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.09 
 
 		 309 aa  140  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  35.69 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  36.58 
 
 		 288 aa  138  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.25 
 
 		 290 aa  137  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  35.81 
 
 		 330 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  35.33 
 
 		 318 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>