More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2502 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  37.36 
 
 		 1241 aa  801    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  53.72 
 
 		 1203 aa  1311    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  52.04 
 
 		 1204 aa  1156    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  54.09 
 
 		 1200 aa  1315    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  51.8 
 
 		 1205 aa  1155    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  51.96 
 
 		 1226 aa  1259    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  50.36 
 
 		 1201 aa  1188    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  49.84 
 
 		 1201 aa  1190    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  55.36 
 
 		 1172 aa  1276    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  75.27 
 
 		 1176 aa  1114    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  54.78 
 
 		 1488 aa  852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  55.48 
 
 		 1201 aa  1302    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  51.8 
 
 		 1205 aa  1158    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  48.37 
 
 		 1208 aa  1151    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  54.69 
 
 		 1233 aa  1326    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  51.99 
 
 		 1210 aa  1254    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  50.32 
 
 		 1204 aa  1184    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  70.9 
 
 		 1179 aa  1729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  58.19 
 
 		 1228 aa  854    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.44 
 
 		 1204 aa  1251    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  48.45 
 
 		 663 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.55 
 
 		 1206 aa  1296    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  54.23 
 
 		 1220 aa  783    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  53.22 
 
 		 1212 aa  1321    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  50.64 
 
 		 1204 aa  1233    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  53.93 
 
 		 1209 aa  1320    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  52.35 
 
 		 1231 aa  1259    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  57.01 
 
 		 1197 aa  861    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  100 
 
 		 1243 aa  2531    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  46.15 
 
 		 1822 aa  1082    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  61.16 
 
 		 1162 aa  834    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  51.87 
 
 		 1197 aa  1254    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  51.31 
 
 		 1209 aa  1250    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  75 
 
 		 1176 aa  1122    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  47.98 
 
 		 1212 aa  1019    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  66.18 
 
 		 1183 aa  1642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  69.8 
 
 		 1179 aa  1689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  59.62 
 
 		 1205 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  69.72 
 
 		 1183 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  58.39 
 
 		 1205 aa  1427    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  50.68 
 
 		 1200 aa  1223    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  74.06 
 
 		 1179 aa  1100    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  70.49 
 
 		 1180 aa  1731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  60.57 
 
 		 1205 aa  891    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  60.7 
 
 		 1205 aa  890    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  51.8 
 
 		 1205 aa  1155    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  55.08 
 
 		 1238 aa  1280    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  54.6 
 
 		 1204 aa  1354    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  50.56 
 
 		 677 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  55.84 
 
 		 1203 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  66.05 
 
 		 1182 aa  1642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  51.27 
 
 		 1207 aa  1221    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  54.07 
 
 		 1203 aa  1328    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  54.66 
 
 		 1208 aa  1343    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  60.7 
 
 		 1205 aa  890    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.63 
 
 		 1209 aa  1251    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  51.4 
 
 		 1234 aa  1174    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  50.11 
 
 		 445 aa  433  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.62 
 
 		 670 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  51.03 
 
 		 665 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  50.9 
 
 		 673 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.56 
 
 		 667 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  50.9 
 
 		 673 aa  420  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.51 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.51 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.51 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  44.02 
 
 		 733 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.45 
 
 		 671 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  48.17 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.51 
 
 		 445 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.51 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.05 
 
 		 670 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.9 
 
 		 655 aa  419  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.89 
 
 		 680 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.28 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0794  pyruvate carboxylase subunit A  47.37 
 
 		 499 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.95 
 
 		 445 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.56 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.12 
 
 		 667 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.13 
 
 		 669 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.28 
 
 		 445 aa  415  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.89 
 
 		 669 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.13 
 
 		 673 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.86 
 
 		 450 aa  416  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.21 
 
 		 655 aa  415  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.05 
 
 		 445 aa  416  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.83 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3483  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  41.23 
 
 		 662 aa  415  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  42.83 
 
 		 681 aa  412  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  45.96 
 
 		 656 aa  410  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  46.14 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2131  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.67 
 
 		 682 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51 
 
 		 668 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.11 
 
 		 682 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2077  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.9 
 
 		 673 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.776074 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.4 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.23 
 
 		 671 aa  413  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1223  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.55 
 
 		 668 aa  412  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3163  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.44 
 
 		 669 aa  412  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49 
 
 		 752 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>