More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5558 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.73 
 
 
1241 aa  847    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  58.82 
 
 
1238 aa  1338    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  53.74 
 
 
1204 aa  1268    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  54.72 
 
 
1243 aa  1335    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  45.68 
 
 
1822 aa  1098    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  56.46 
 
 
1226 aa  1340    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  57.31 
 
 
1200 aa  1315    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  58.3 
 
 
663 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  57.63 
 
 
1179 aa  1342    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  58.38 
 
 
1203 aa  1332    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  59.36 
 
 
1228 aa  1355    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  59.26 
 
 
1488 aa  892    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  63.54 
 
 
1201 aa  1457    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  62.56 
 
 
1233 aa  1418    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  59.53 
 
 
1176 aa  1351    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  56.86 
 
 
677 aa  733    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  58.02 
 
 
1210 aa  1362    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  56.98 
 
 
1180 aa  1295    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  56.5 
 
 
1231 aa  1325    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  59.45 
 
 
1182 aa  1378    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  61.59 
 
 
1203 aa  1432    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  54.52 
 
 
1204 aa  1286    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  81.21 
 
 
1203 aa  1951    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  55.08 
 
 
1207 aa  1281    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  54.85 
 
 
1206 aa  1331    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  57.78 
 
 
1201 aa  1308    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  61.47 
 
 
1212 aa  1508    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  59.53 
 
 
1179 aa  1322    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  56.77 
 
 
1205 aa  1213    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  56.86 
 
 
1205 aa  1216    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  55.82 
 
 
1197 aa  1303    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  62.86 
 
 
1208 aa  1500    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51.66 
 
 
1208 aa  1222    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  53.89 
 
 
1212 aa  1081    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  58.63 
 
 
1172 aa  1357    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  56.41 
 
 
1209 aa  1343    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  58.11 
 
 
1179 aa  1358    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  59.27 
 
 
1183 aa  1377    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  59.29 
 
 
1197 aa  1347    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  61.66 
 
 
1200 aa  1459    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  98.51 
 
 
1205 aa  2383    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  81.24 
 
 
1205 aa  1927    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  55.75 
 
 
1209 aa  1307    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  54.25 
 
 
1204 aa  1264    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  58.16 
 
 
1183 aa  1342    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  61.26 
 
 
1209 aa  1477    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  55.29 
 
 
1204 aa  1141    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  57.31 
 
 
1162 aa  1195    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  61.76 
 
 
1204 aa  1490    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  54.43 
 
 
1220 aa  1174    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
1205 aa  2415    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  56.77 
 
 
1205 aa  1213    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  100 
 
 
1205 aa  2415    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  59.45 
 
 
1176 aa  1348    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  59.06 
 
 
1205 aa  1379    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  52.25 
 
 
1201 aa  1182    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  54.89 
 
 
1234 aa  1252    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.69 
 
 
655 aa  412  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  51.33 
 
 
666 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  51.24 
 
 
673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  51.46 
 
 
673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  49.44 
 
 
695 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.57 
 
 
680 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.44 
 
 
666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.67 
 
 
667 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.66 
 
 
666 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.67 
 
 
667 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  46.94 
 
 
733 aa  404  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0434  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.82 
 
 
659 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  51.24 
 
 
665 aa  406  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.62 
 
 
655 aa  404  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.67 
 
 
676 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.89 
 
 
671 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.1 
 
 
686 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  51.47 
 
 
643 aa  403  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3684  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.86 
 
 
685 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.82326  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  51.35 
 
 
645 aa  403  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.45 
 
 
667 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.44 
 
 
670 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.38 
 
 
681 aa  402  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.31 
 
 
446 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0311  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.82 
 
 
706 aa  400  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  43.99 
 
 
656 aa  399  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  47.53 
 
 
446 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.89 
 
 
667 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.42 
 
 
662 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.37 
 
 
450 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.58 
 
 
670 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4535  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.67 
 
 
662 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.58 
 
 
445 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2379  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.23 
 
 
682 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2788  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.55 
 
 
673 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683073  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  51.22 
 
 
661 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0342  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.31 
 
 
704 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.22 
 
 
673 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.4 
 
 
450 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.1 
 
 
671 aa  396  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3403  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.34 
 
 
696 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  51 
 
 
661 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.88 
 
 
654 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>