More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0045 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.76 
 
 		 1241 aa  829    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  51.7 
 
 		 1162 aa  1096    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.11 
 
 		 1204 aa  1128    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  53.42 
 
 		 1207 aa  1264    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  57.23 
 
 		 1205 aa  1347    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  58.09 
 
 		 1231 aa  1357    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  58.35 
 
 		 1226 aa  1362    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  49.34 
 
 		 1212 aa  999    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.3 
 
 		 1220 aa  1155    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  54.05 
 
 		 1179 aa  1214    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  58.82 
 
 		 1200 aa  1345    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  59.1 
 
 		 1488 aa  922    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  58.51 
 
 		 1201 aa  1347    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  58.95 
 
 		 1233 aa  1347    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  58.68 
 
 		 1204 aa  1392    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  51.52 
 
 		 1243 aa  1271    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  58.79 
 
 		 1210 aa  1363    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  54.64 
 
 		 1182 aa  1292    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  51.68 
 
 		 1209 aa  1233    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  53.47 
 
 		 1206 aa  1288    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  56.22 
 
 		 1228 aa  1279    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.02 
 
 		 1204 aa  1229    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  56.88 
 
 		 1212 aa  1379    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  52.73 
 
 		 1234 aa  1172    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  52.17 
 
 		 1205 aa  1121    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.49 
 
 		 1179 aa  1224    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  58.96 
 
 		 1205 aa  1353    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  55.8 
 
 		 1238 aa  1285    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  56.11 
 
 		 1197 aa  1286    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  58.24 
 
 		 1208 aa  1391    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  59.19 
 
 		 1203 aa  1346    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  60.58 
 
 		 1209 aa  1466    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  50.82 
 
 		 1204 aa  1213    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  56.45 
 
 		 1209 aa  1353    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  55.42 
 
 		 1183 aa  1292    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  58.66 
 
 		 1205 aa  1343    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  100 
 
 		 1197 aa  2444    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  53.26 
 
 		 1183 aa  1246    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  58.68 
 
 		 1203 aa  1367    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.29 
 
 		 1179 aa  1241    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.87 
 
 		 1822 aa  1064    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  53.77 
 
 		 677 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  52.43 
 
 		 1208 aa  1255    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  58.77 
 
 		 1205 aa  1346    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  52.08 
 
 		 1205 aa  1117    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  51.03 
 
 		 1204 aa  1184    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  58.77 
 
 		 1205 aa  1346    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  52.08 
 
 		 1205 aa  1117    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  50.78 
 
 		 1201 aa  1159    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  53.54 
 
 		 1176 aa  1231    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  59.44 
 
 		 1201 aa  1343    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  57.91 
 
 		 1200 aa  1364    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  55.16 
 
 		 1172 aa  1289    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  59.64 
 
 		 1203 aa  1389    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.96 
 
 		 1180 aa  1221    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  53.67 
 
 		 1176 aa  1236    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  51.58 
 
 		 663 aa  632  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.06 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.06 
 
 		 445 aa  400  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.29 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1070  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  44.27 
 
 		 661 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.29 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.06 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.72 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.06 
 
 		 445 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.06 
 
 		 445 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.06 
 
 		 445 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0962  biotin carboxylase  44.27 
 
 		 661 aa  396  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.06 
 
 		 445 aa  396  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.65 
 
 		 445 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2788  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.31 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683073  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  45.73 
 
 		 654 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.42 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2064  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  41.27 
 
 		 700 aa  388  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  44.72 
 
 		 654 aa  386  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  44.49 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0434  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.29 
 
 		 659 aa  386  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1333  pyruvate carboxylase subunit A  42.99 
 
 		 497 aa  386  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1342  pyruvate carboxylase subunit A  42.76 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.492096  normal  0.0929613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  44.04 
 
 		 686 aa  383  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.78 
 
 		 668 aa  383  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0437  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.94 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1473  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  46.41 
 
 		 666 aa  380  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  42.04 
 
 		 656 aa  379  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  39.83 
 
 		 493 aa  380  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2509  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.32 
 
 		 646 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.12 
 
 		 682 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  43.67 
 
 		 655 aa  379  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.95 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  44.82 
 
 		 671 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.22 
 
 		 645 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.21 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3221  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.95 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.390977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1600  methylcrotonyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.15 
 
 		 681 aa  376  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0611  pyruvate carboxylase subunit A  41.86 
 
 		 497 aa  376  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.937558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.71 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  43.89 
 
 		 665 aa  376  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1147  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.76 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.221564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2167  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  44.54 
 
 		 682 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.84 
 
 		 652 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>