More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1821 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.75 
 
 
1241 aa  805    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  54.8 
 
 
1203 aa  1251    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  55.83 
 
 
1176 aa  1223    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  62.62 
 
 
1212 aa  1331    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  52.4 
 
 
1226 aa  1212    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  50.62 
 
 
1204 aa  1138    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  54.64 
 
 
1179 aa  1238    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  54.39 
 
 
1488 aa  793    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  54.34 
 
 
1201 aa  1234    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  52.64 
 
 
1231 aa  1191    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  53.85 
 
 
1180 aa  1192    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  54.58 
 
 
1233 aa  1219    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  52.79 
 
 
1200 aa  1195    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  56.94 
 
 
1205 aa  1264    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  57.02 
 
 
1203 aa  1306    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.36 
 
 
1204 aa  1186    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  52.84 
 
 
1210 aa  1211    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  54.03 
 
 
1228 aa  1186    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  54.18 
 
 
1179 aa  1225    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  99.83 
 
 
1205 aa  2382    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.83 
 
 
1205 aa  1273    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  100 
 
 
1205 aa  2387    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  50.25 
 
 
1206 aa  1222    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  62.58 
 
 
1220 aa  1383    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  52.39 
 
 
1212 aa  1254    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  64.38 
 
 
1204 aa  1364    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.35 
 
 
1209 aa  1154    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  50.87 
 
 
1207 aa  1163    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  50.71 
 
 
1208 aa  1164    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  50.66 
 
 
1204 aa  1174    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  54.88 
 
 
1197 aa  1268    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  66.31 
 
 
677 aa  855    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  55 
 
 
1204 aa  1290    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  51.8 
 
 
1243 aa  1212    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  54.43 
 
 
1200 aa  1246    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  50.08 
 
 
1209 aa  1183    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  67.17 
 
 
663 aa  870    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  53.23 
 
 
1183 aa  1201    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  57.31 
 
 
1205 aa  1272    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  55.19 
 
 
1179 aa  1169    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  53.05 
 
 
1183 aa  1204    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.91 
 
 
1822 aa  1040    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  53.97 
 
 
1172 aa  1230    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  52.8 
 
 
1201 aa  1192    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  55.06 
 
 
1238 aa  1233    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  56.86 
 
 
1205 aa  1261    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  99.83 
 
 
1205 aa  2382    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  49.26 
 
 
1201 aa  1087    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  55.78 
 
 
1176 aa  1222    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  53.39 
 
 
1182 aa  1228    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  52.54 
 
 
1197 aa  1152    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  69.43 
 
 
1234 aa  1608    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  56.86 
 
 
1205 aa  1261    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  53.4 
 
 
1203 aa  1169    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  56.03 
 
 
1209 aa  1322    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  53.59 
 
 
1162 aa  1108    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  53.02 
 
 
1208 aa  1235    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50 
 
 
665 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.45 
 
 
669 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  48.34 
 
 
666 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  50.34 
 
 
643 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.07 
 
 
752 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.12 
 
 
667 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50 
 
 
668 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.48 
 
 
734 aa  387  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.54 
 
 
671 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.12 
 
 
667 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2736  biotin carboxylase/biotin-containing subunit  48.16 
 
 
649 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2316  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.32 
 
 
662 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459588  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.23 
 
 
667 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.99 
 
 
666 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.55 
 
 
667 aa  383  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.43 
 
 
445 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2467  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  49.66 
 
 
649 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30197  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.33 
 
 
670 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  49.55 
 
 
654 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2077  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.11 
 
 
673 aa  380  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.776074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.1 
 
 
666 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.46 
 
 
733 aa  380  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.67 
 
 
449 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.95 
 
 
445 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.71 
 
 
445 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.71 
 
 
445 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.71 
 
 
445 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2694  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.4 
 
 
661 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250479  normal  0.322946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.25 
 
 
652 aa  376  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1604  carbamoyl-phosphate synthetase large chain  50 
 
 
668 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0456964  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.69 
 
 
450 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  47.1 
 
 
695 aa  376  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.71 
 
 
445 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.52 
 
 
445 aa  376  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.2 
 
 
655 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46 
 
 
654 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  50 
 
 
673 aa  377  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.95 
 
 
445 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.88 
 
 
671 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0319  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.93 
 
 
689 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.1 
 
 
670 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  46.64 
 
 
661 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.95 
 
 
445 aa  376  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>