More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3900 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.35 
 
 
1241 aa  800    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  53.9 
 
 
1203 aa  1206    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  59.78 
 
 
1205 aa  1352    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  56.8 
 
 
1208 aa  1359    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  55.1 
 
 
663 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  56.63 
 
 
1200 aa  1284    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  53.68 
 
 
1226 aa  1243    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  92.71 
 
 
1176 aa  2140    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  73.94 
 
 
1243 aa  1122    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  57.13 
 
 
1209 aa  1341    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  55.81 
 
 
1205 aa  1163    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  52.39 
 
 
1204 aa  1219    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  56.08 
 
 
1488 aa  818    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  57.4 
 
 
1201 aa  1285    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  77.17 
 
 
1180 aa  1792    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  53.92 
 
 
1200 aa  1234    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  59.63 
 
 
1233 aa  1333    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  57.49 
 
 
1204 aa  1345    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51.5 
 
 
1208 aa  1177    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  53.5 
 
 
1209 aa  1190    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  53.88 
 
 
1210 aa  1256    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  56.74 
 
 
1228 aa  1277    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  75.28 
 
 
1179 aa  1785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  58.28 
 
 
1203 aa  1341    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  64.12 
 
 
1162 aa  1331    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  53.02 
 
 
1206 aa  1276    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  53.74 
 
 
1220 aa  1136    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  75.44 
 
 
1179 aa  1794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  55.95 
 
 
1212 aa  1332    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  61.62 
 
 
1205 aa  1431    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  54.42 
 
 
1201 aa  1236    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  56.46 
 
 
1197 aa  1273    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  55.64 
 
 
1205 aa  1157    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  57.8 
 
 
1238 aa  1277    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  53.57 
 
 
1231 aa  1236    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  52.24 
 
 
1209 aa  1221    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  71.2 
 
 
1183 aa  1675    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  54.55 
 
 
677 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  52.81 
 
 
1212 aa  1037    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  58.95 
 
 
1205 aa  1333    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  70.31 
 
 
1183 aa  1658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  54.78 
 
 
1197 aa  1244    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  53.22 
 
 
1204 aa  1179    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  58.57 
 
 
1203 aa  1341    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  100 
 
 
1179 aa  2343    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  70.35 
 
 
1182 aa  1652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  54.9 
 
 
1204 aa  1124    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  59.95 
 
 
1205 aa  1349    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  55.64 
 
 
1205 aa  1157    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  52.45 
 
 
1201 aa  1153    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  45.89 
 
 
1822 aa  1070    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  53.5 
 
 
1207 aa  1207    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  53.96 
 
 
1234 aa  1181    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  59.95 
 
 
1205 aa  1349    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  53.21 
 
 
1204 aa  1231    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  63.81 
 
 
1172 aa  1493    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  92.87 
 
 
1176 aa  2136    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.46 
 
 
680 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.24 
 
 
671 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.98 
 
 
655 aa  404  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.34 
 
 
670 aa  406  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.9 
 
 
670 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49 
 
 
682 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.1 
 
 
671 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  45.51 
 
 
656 aa  401  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.8 
 
 
665 aa  403  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.91 
 
 
673 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.450975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.33 
 
 
667 aa  403  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.34 
 
 
676 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.34 
 
 
669 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.33 
 
 
667 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.93 
 
 
681 aa  399  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0052  biotin carboxylase  48.19 
 
 
662 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3403  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.22 
 
 
696 aa  399  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1853  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.33 
 
 
682 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1395  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.74 
 
 
448 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150284  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3163  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.56 
 
 
669 aa  399  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.33 
 
 
667 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.65 
 
 
662 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.22 
 
 
667 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.59 
 
 
450 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.55 
 
 
668 aa  396  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.87 
 
 
662 aa  396  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2043  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.11 
 
 
682 aa  396  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114869  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.12 
 
 
666 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.83 
 
 
673 aa  396  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  50 
 
 
666 aa  396  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.89 
 
 
666 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.13 
 
 
671 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  51.87 
 
 
662 aa  396  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.45 
 
 
682 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.11 
 
 
752 aa  396  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  50.11 
 
 
673 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2379  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.56 
 
 
682 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315609  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.34 
 
 
669 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2802  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.31 
 
 
684 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314171  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1223  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.56 
 
 
668 aa  393  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 
445 aa  393  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3221  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.44 
 
 
667 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.390977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1454  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.73 
 
 
448 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>