More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2163 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  41.49 
 
 		 1241 aa  926    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  53.26 
 
 		 1179 aa  1191    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  51.36 
 
 		 1205 aa  1130    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  51.65 
 
 		 1226 aa  1214    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  52.36 
 
 		 1822 aa  1306    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  51.02 
 
 		 1200 aa  1197    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.04 
 
 		 1205 aa  1293    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  56.62 
 
 		 1488 aa  863    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  56.22 
 
 		 1201 aa  1300    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.65 
 
 		 1180 aa  1188    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  51.44 
 
 		 1243 aa  1251    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  55.82 
 
 		 1233 aa  1298    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  49.43 
 
 		 1220 aa  1087    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  48.96 
 
 		 1162 aa  1053    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  51.72 
 
 		 1210 aa  1217    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  55.34 
 
 		 1208 aa  1314    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  80.25 
 
 		 1204 aa  1966    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  51.28 
 
 		 1205 aa  1126    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  53.75 
 
 		 1238 aa  1221    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  50.12 
 
 		 1206 aa  1215    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  56.19 
 
 		 1200 aa  1327    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  54.26 
 
 		 1212 aa  1339    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  51.23 
 
 		 1212 aa  1073    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  53.68 
 
 		 1228 aa  1261    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  51.89 
 
 		 1231 aa  1224    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  53.09 
 
 		 1197 aa  1265    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  53.43 
 
 		 1182 aa  1271    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  55.09 
 
 		 1209 aa  1331    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  51.1 
 
 		 1209 aa  1256    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.67 
 
 		 1179 aa  1263    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  93.77 
 
 		 1204 aa  2326    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  52.88 
 
 		 1183 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  53.22 
 
 		 1176 aa  1215    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  53.14 
 
 		 1205 aa  1226    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  53.35 
 
 		 1179 aa  1258    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  55.11 
 
 		 1203 aa  1304    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  51.64 
 
 		 1183 aa  1229    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  51.19 
 
 		 1204 aa  1123    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  48.97 
 
 		 1201 aa  1141    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  51.29 
 
 		 1197 aa  1217    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  54.15 
 
 		 1172 aa  1253    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  54.66 
 
 		 1205 aa  1274    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  75.42 
 
 		 1207 aa  1863    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  54.28 
 
 		 1205 aa  1269    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  51.28 
 
 		 1205 aa  1126    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  56.69 
 
 		 1204 aa  1353    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  53.3 
 
 		 1176 aa  1213    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  59.42 
 
 		 1208 aa  1454    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  51.56 
 
 		 1203 aa  1189    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  53.1 
 
 		 1203 aa  1247    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  50.29 
 
 		 677 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  100 
 
 		 1204 aa  2464    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  50.33 
 
 		 1234 aa  1127    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  75.81 
 
 		 1209 aa  1845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  54.28 
 
 		 1205 aa  1269    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  51.22 
 
 		 1201 aa  1195    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  47.63 
 
 		 663 aa  622  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.3 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.14 
 
 		 445 aa  413  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  51.35 
 
 		 654 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.14 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.45 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.45 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.22 
 
 		 445 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2131  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.78 
 
 		 682 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.82 
 
 		 665 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.78 
 
 		 667 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  50 
 
 		 673 aa  400  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1358  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  50.45 
 
 		 680 aa  400  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.410164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.55 
 
 		 682 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.16 
 
 		 678 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2379  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.67 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  49.78 
 
 		 673 aa  396  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.87 
 
 		 666 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3403  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.56 
 
 		 696 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1853  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.78 
 
 		 682 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1147  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.79 
 
 		 667 aa  397  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.221564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  48.58 
 
 		 643 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.55 
 
 		 682 aa  396  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2043  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.55 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  49.67 
 
 		 662 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  44.99 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  43.46 
 
 		 670 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.67 
 
 		 662 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.79 
 
 		 667 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  48.2 
 
 		 695 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.78 
 
 		 655 aa  393  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.57 
 
 		 666 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  49.22 
 
 		 666 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3684  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.61 
 
 		 685 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.82326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.42 
 
 		 660 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2788  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.68 
 
 		 673 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683073  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.39 
 
 		 448 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.54 
 
 		 680 aa  389  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>