More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0710 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.87 
 
 
1241 aa  815    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  51.47 
 
 
1200 aa  1170    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  53.73 
 
 
1205 aa  1166    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  52.16 
 
 
1228 aa  1128    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  51.07 
 
 
1182 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  49.48 
 
 
1226 aa  1120    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  52.88 
 
 
1176 aa  1119    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  50.17 
 
 
1179 aa  1101    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  57.96 
 
 
663 aa  707    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  49.46 
 
 
1203 aa  1062    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  52.31 
 
 
1488 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  52.23 
 
 
1201 aa  1173    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  48.77 
 
 
1201 aa  1079    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  53.37 
 
 
1233 aa  1162    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  48.21 
 
 
1243 aa  1102    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  50.78 
 
 
1204 aa  1187    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  51.73 
 
 
1203 aa  1171    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  48.14 
 
 
1210 aa  1100    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  50.74 
 
 
1209 aa  1123    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  52.65 
 
 
1203 aa  1165    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  45.66 
 
 
1206 aa  1113    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  50.99 
 
 
1172 aa  1139    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  56.55 
 
 
1220 aa  1205    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  47.09 
 
 
1212 aa  1133    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  62.88 
 
 
1205 aa  1365    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  51.03 
 
 
1197 aa  1150    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  53.14 
 
 
1176 aa  1121    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  52.71 
 
 
1179 aa  1088    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  49.14 
 
 
1208 aa  1155    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  100 
 
 
1212 aa  2338    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  50.24 
 
 
1231 aa  1106    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  48.04 
 
 
1208 aa  1109    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  46.76 
 
 
1209 aa  1091    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  51.4 
 
 
1205 aa  1156    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  51.2 
 
 
1183 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.19 
 
 
1204 aa  1178    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  52.4 
 
 
1205 aa  1148    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  50.25 
 
 
1183 aa  1108    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  42.33 
 
 
1822 aa  995    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  54.8 
 
 
677 aa  693    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  49.63 
 
 
1197 aa  1074    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  49.88 
 
 
1204 aa  1127    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  52.25 
 
 
1238 aa  1155    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  53.81 
 
 
1205 aa  1164    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  62.8 
 
 
1205 aa  1362    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  51.03 
 
 
1209 aa  1198    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  50.29 
 
 
1179 aa  1103    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  50.83 
 
 
1162 aa  1006    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  48.2 
 
 
1201 aa  1053    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  60.07 
 
 
1234 aa  1355    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  50.45 
 
 
1204 aa  1154    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  53.81 
 
 
1205 aa  1164    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  47.96 
 
 
1200 aa  1072    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  62.69 
 
 
1204 aa  1282    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  49.55 
 
 
1207 aa  1127    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  51.49 
 
 
1180 aa  1097    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  62.8 
 
 
1205 aa  1362    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  53.28 
 
 
665 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  53.54 
 
 
643 aa  400  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  53.67 
 
 
734 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  52.67 
 
 
654 aa  390  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0007  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.98 
 
 
465 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.47 
 
 
652 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.62 
 
 
752 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0597  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  52.34 
 
 
457 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2788  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.23 
 
 
673 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683073  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  45.03 
 
 
733 aa  383  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1855  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.41 
 
 
666 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181486  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.22 
 
 
733 aa  383  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2809  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.79 
 
 
670 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.978814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5118  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.54 
 
 
666 aa  380  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.12 
 
 
671 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2124  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.54 
 
 
666 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  52.56 
 
 
662 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.21 
 
 
660 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.56 
 
 
662 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1727  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.18 
 
 
667 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.290764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4585  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.54 
 
 
666 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6512  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.23 
 
 
621 aa  376  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0609774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1604  carbamoyl-phosphate synthetase large chain  52 
 
 
668 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0456964  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0426  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  52.71 
 
 
665 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.967801  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.81 
 
 
667 aa  376  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0350  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.89 
 
 
679 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2535  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.89 
 
 
671 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.23 
 
 
645 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3851  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  53.78 
 
 
704 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.551732  normal  0.392028 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.12 
 
 
662 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1359  3-methylcrotonyl-CoA carboxylase alpha subunit  49.77 
 
 
673 aa  376  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1070  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  43.24 
 
 
661 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3760  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  50.78 
 
 
662 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156644  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.93 
 
 
667 aa  373  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  47.03 
 
 
666 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3469  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.32 
 
 
670 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2781  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.22 
 
 
667 aa  373  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940378  normal  0.476201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.27 
 
 
450 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0962  biotin carboxylase  43.24 
 
 
661 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11348  biotin carboxylase (accC)  44.37 
 
 
480 aa  373  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0917166  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.71 
 
 
445 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5868  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.38 
 
 
462 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4376  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.12 
 
 
621 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.672577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>