More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4017 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.05 
 
 		 1241 aa  805    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  55.5 
 
 		 1204 aa  1134    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  57.9 
 
 		 1203 aa  1335    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  56.14 
 
 		 1208 aa  1346    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  53.3 
 
 		 1204 aa  1229    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  56.08 
 
 		 1205 aa  1173    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  52.65 
 
 		 1204 aa  1216    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  52.78 
 
 		 1226 aa  1234    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  56.47 
 
 		 1204 aa  1332    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  70.7 
 
 		 1182 aa  1672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  53.17 
 
 		 1231 aa  1231    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  56.1 
 
 		 1488 aa  826    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  57.77 
 
 		 1201 aa  1292    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  53.06 
 
 		 1207 aa  1199    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51.79 
 
 		 1208 aa  1179    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  58.88 
 
 		 1233 aa  1318    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  54.35 
 
 		 1220 aa  1157    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  53.72 
 
 		 1210 aa  1255    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  92.71 
 
 		 1179 aa  2096    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  53.88 
 
 		 663 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.8 
 
 		 1209 aa  1188    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  56.94 
 
 		 1200 aa  1298    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  74.79 
 
 		 1179 aa  1781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.32 
 
 		 1206 aa  1267    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  59.4 
 
 		 1205 aa  1353    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  75.38 
 
 		 1179 aa  1793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  55.33 
 
 		 1212 aa  1323    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  53.76 
 
 		 1200 aa  1238    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  63.37 
 
 		 1162 aa  1327    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  64.6 
 
 		 1172 aa  1508    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  75 
 
 		 1243 aa  1135    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  56.62 
 
 		 1197 aa  1280    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  57.83 
 
 		 1238 aa  1281    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  58.47 
 
 		 1203 aa  1345    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  57.86 
 
 		 1209 aa  1357    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  54.64 
 
 		 677 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  52.33 
 
 		 1209 aa  1220    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  71.3 
 
 		 1183 aa  1692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  52.73 
 
 		 1212 aa  1043    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  52.24 
 
 		 1201 aa  1161    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  58.5 
 
 		 1205 aa  1332    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  70.84 
 
 		 1183 aa  1676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  56.34 
 
 		 1228 aa  1262    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  56.16 
 
 		 1205 aa  1177    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  59.53 
 
 		 1205 aa  1350    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  56.08 
 
 		 1205 aa  1173    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  61.44 
 
 		 1205 aa  1428    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  46.01 
 
 		 1822 aa  1069    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  77.8 
 
 		 1180 aa  1808    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  52.68 
 
 		 1204 aa  1179    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  97.7 
 
 		 1176 aa  2242    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  53.99 
 
 		 1234 aa  1177    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  100 
 
 		 1176 aa  2341    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  59.53 
 
 		 1205 aa  1350    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  54.06 
 
 		 1197 aa  1236    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  54.09 
 
 		 1201 aa  1234    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  53.62 
 
 		 1203 aa  1208    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.03 
 
 		 670 aa  416  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.77 
 
 		 671 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.24 
 
 		 680 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  51.48 
 
 		 665 aa  412  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.11 
 
 		 682 aa  410  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2043  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.22 
 
 		 682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.35 
 
 		 671 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49 
 
 		 669 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.93 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.67 
 
 		 668 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3163  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.22 
 
 		 669 aa  406  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.41 
 
 		 681 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.78 
 
 		 673 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.450975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.76 
 
 		 655 aa  405  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1395  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.2 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  43.08 
 
 		 666 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1853  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49 
 
 		 682 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.23 
 
 		 671 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.12 
 
 		 676 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  52.31 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.31 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  51.39 
 
 		 667 aa  403  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.9 
 
 		 673 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50 
 
 		 666 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.43 
 
 		 662 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  46.81 
 
 		 733 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1736  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  49.32 
 
 		 671 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.124901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.11 
 
 		 670 aa  403  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.44 
 
 		 682 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  51.16 
 
 		 667 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.12 
 
 		 678 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3403  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.67 
 
 		 696 aa  402  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.68 
 
 		 669 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1223  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.67 
 
 		 668 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  51.8 
 
 		 673 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  51.58 
 
 		 673 aa  399  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  45.68 
 
 		 656 aa  398  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.89 
 
 		 667 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.44 
 
 		 667 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4726  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.32 
 
 		 675 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248111  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3684  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.28 
 
 		 685 aa  399  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.82326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.32 
 
 		 666 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.46 
 
 		 752 aa  399  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>