More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0798 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.86 
 
 
1241 aa  889    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  58.24 
 
 
1197 aa  1390    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  62.96 
 
 
1200 aa  1531    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  48.81 
 
 
1212 aa  1078    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  56.23 
 
 
1226 aa  1370    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  56.21 
 
 
1179 aa  1367    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  55.33 
 
 
1204 aa  1299    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  56.09 
 
 
1207 aa  1328    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  53.85 
 
 
1162 aa  1193    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  58.85 
 
 
1203 aa  1383    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  58.34 
 
 
1488 aa  923    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  58.55 
 
 
1205 aa  1436    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  63.36 
 
 
1201 aa  1541    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  55.34 
 
 
1204 aa  1332    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  55.14 
 
 
1180 aa  1320    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  59.7 
 
 
1233 aa  1427    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  57.03 
 
 
1182 aa  1393    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.15 
 
 
1220 aa  1204    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  57.39 
 
 
1228 aa  1378    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  57.95 
 
 
1210 aa  1401    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  56.63 
 
 
1179 aa  1326    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  54.44 
 
 
1209 aa  1311    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  70.32 
 
 
1204 aa  1768    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  58.1 
 
 
1200 aa  1402    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  54.72 
 
 
663 aa  726    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  58.48 
 
 
1201 aa  1384    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  51.94 
 
 
1204 aa  1157    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  58.91 
 
 
1206 aa  1444    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  54.66 
 
 
1243 aa  1361    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  61.91 
 
 
1203 aa  1509    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  63.49 
 
 
1212 aa  1583    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  52.88 
 
 
1205 aa  1193    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  56.67 
 
 
1197 aa  1387    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  56.58 
 
 
1179 aa  1369    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  51.28 
 
 
1201 aa  1218    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  58.57 
 
 
1209 aa  1428    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  63.67 
 
 
1203 aa  1543    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  56.49 
 
 
1183 aa  1391    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  58.41 
 
 
1238 aa  1374    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  54.89 
 
 
1204 aa  1314    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  63.47 
 
 
1205 aa  1519    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  59.72 
 
 
1172 aa  1432    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  57.21 
 
 
1183 aa  1385    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  55.92 
 
 
1231 aa  1355    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  64.8 
 
 
1209 aa  1582    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  100 
 
 
1208 aa  2484    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  56.3 
 
 
1176 aa  1345    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  52.52 
 
 
1208 aa  1287    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  53.87 
 
 
677 aa  723    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  62.97 
 
 
1205 aa  1503    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  52.8 
 
 
1205 aa  1189    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  52.8 
 
 
1205 aa  1189    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  55.8 
 
 
1176 aa  1339    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  45.76 
 
 
1822 aa  1123    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  62.97 
 
 
1205 aa  1504    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  53.9 
 
 
1234 aa  1259    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  62.97 
 
 
1205 aa  1503    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  49.33 
 
 
686 aa  432  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  51.2 
 
 
662 aa  426  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817206  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.46 
 
 
655 aa  421  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.31 
 
 
445 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  50.88 
 
 
661 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.55 
 
 
662 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  47.67 
 
 
656 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.65 
 
 
450 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1855  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.7 
 
 
666 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181486  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.57 
 
 
680 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.6 
 
 
671 aa  419  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  44.12 
 
 
670 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.81 
 
 
645 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  48.93 
 
 
654 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  51.01 
 
 
666 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  48.55 
 
 
654 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  47.3 
 
 
654 aa  415  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1736  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  49.66 
 
 
671 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.124901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.76 
 
 
447 aa  416  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.44 
 
 
678 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0608  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, subunit alpha  50.9 
 
 
679 aa  416  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00695575  normal  0.371744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0319  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.33 
 
 
689 aa  416  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.85 
 
 
662 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0962  biotin carboxylase  46.76 
 
 
661 aa  411  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.22 
 
 
667 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.22 
 
 
667 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5118  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.89 
 
 
666 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1070  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.76 
 
 
661 aa  412  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.37 
 
 
671 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3352  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.44 
 
 
671 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.78 
 
 
448 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.78 
 
 
668 aa  413  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  48.85 
 
 
662 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49 
 
 
670 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  49.89 
 
 
661 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3040  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.45 
 
 
672 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1600  methylcrotonyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.55 
 
 
681 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.72 
 
 
447 aa  410  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2788  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.57 
 
 
673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683073  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.03 
 
 
671 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4351  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.89 
 
 
677 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5237  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.89 
 
 
665 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578975  normal  0.758885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>