More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4243 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.64 
 
 		 1241 aa  810    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  54.7 
 
 		 1228 aa  1293    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.49 
 
 		 1205 aa  1297    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  50.28 
 
 		 1220 aa  1141    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  52.78 
 
 		 1176 aa  1214    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  52.4 
 
 		 1205 aa  1154    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  100 
 
 		 1226 aa  2499    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  59.69 
 
 		 1204 aa  1425    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  56.23 
 
 		 1208 aa  1348    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  49.72 
 
 		 1208 aa  1177    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.31 
 
 		 1209 aa  1217    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  57.94 
 
 		 1200 aa  1376    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  57.46 
 
 		 1209 aa  1363    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  88.6 
 
 		 1488 aa  1497    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  58.04 
 
 		 1201 aa  1357    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  55.85 
 
 		 1203 aa  1320    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  58.44 
 
 		 1233 aa  1339    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  52.81 
 
 		 1179 aa  1242    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  71.92 
 
 		 1200 aa  1768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.08 
 
 		 1822 aa  1019    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  54.06 
 
 		 1172 aa  1280    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  81.81 
 
 		 1210 aa  2032    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.11 
 
 		 1204 aa  1132    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  72.61 
 
 		 1201 aa  1776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  53.23 
 
 		 677 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.99 
 
 		 1206 aa  1301    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  52.37 
 
 		 1162 aa  1140    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  50.94 
 
 		 1201 aa  1180    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  58.39 
 
 		 1212 aa  1439    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  52.37 
 
 		 1182 aa  1246    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  59.5 
 
 		 1203 aa  1398    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  53.18 
 
 		 1197 aa  1265    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  53.43 
 
 		 1179 aa  1194    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  50.94 
 
 		 663 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.65 
 
 		 1204 aa  1214    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  56.5 
 
 		 1209 aa  1388    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  51.98 
 
 		 1204 aa  1201    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  79.8 
 
 		 1231 aa  1959    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  51.09 
 
 		 1204 aa  1195    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  53.43 
 
 		 1183 aa  1256    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.64 
 
 		 1180 aa  1221    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  56.1 
 
 		 1205 aa  1293    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  53.39 
 
 		 1176 aa  1230    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  52.41 
 
 		 1183 aa  1221    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  49.16 
 
 		 1212 aa  1031    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  56.03 
 
 		 1238 aa  1292    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  58.63 
 
 		 1197 aa  1345    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  52.32 
 
 		 1205 aa  1150    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  56.24 
 
 		 1205 aa  1322    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  52.32 
 
 		 1205 aa  1150    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.89 
 
 		 1179 aa  1239    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  56.32 
 
 		 1205 aa  1331    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  73.59 
 
 		 1203 aa  1791    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  50.97 
 
 		 1207 aa  1179    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  56.24 
 
 		 1205 aa  1322    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  51.96 
 
 		 1243 aa  1259    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  53.08 
 
 		 1234 aa  1186    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.1 
 
 		 652 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1333  pyruvate carboxylase subunit A  45.19 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1342  pyruvate carboxylase subunit A  44.52 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.492096  normal  0.0929613 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  47.2 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.76 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.62 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  47.2 
 
 		 654 aa  396  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  47.06 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0611  pyruvate carboxylase subunit A  45.19 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.937558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.52 
 
 		 450 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.1 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.41 
 
 		 448 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  44.74 
 
 		 498 aa  393  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.1 
 
 		 667 aa  389  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.17 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.97 
 
 		 671 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.33 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.85 
 
 		 662 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  44.87 
 
 		 448 aa  390  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1660  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.19 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.07 
 
 		 445 aa  389  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.87 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.65 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.65 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.82 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.87 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.85 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1455  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.67 
 
 		 449 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0675  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.43 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03221  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.05 
 
 		 448 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.61 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3221  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.85 
 
 		 667 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.390977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1426  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.44 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.65 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.74 
 
 		 450 aa  386  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0175  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.86 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.65 
 
 		 445 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.65 
 
 		 445 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.49 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.59 
 
 		 447 aa  383  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.4 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.84 
 
 		 671 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1065  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.62 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000015139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>