More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3977 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  43.33 
 
 		 1241 aa  649    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  54.39 
 
 		 1205 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  56 
 
 		 1180 aa  808    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  55.16 
 
 		 1204 aa  740    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  62.23 
 
 		 1204 aa  955    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  55.3 
 
 		 1204 aa  832    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  56.08 
 
 		 1179 aa  808    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  59.11 
 
 		 1203 aa  912    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  88.6 
 
 		 1226 aa  1497    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  52.17 
 
 		 1212 aa  691    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  55.09 
 
 		 1179 aa  818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  54.78 
 
 		 1243 aa  852    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  80.49 
 
 		 1231 aa  1251    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  100 
 
 		 1488 aa  3024    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  77.45 
 
 		 1203 aa  1195    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  61.26 
 
 		 1201 aa  904    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  58.04 
 
 		 1203 aa  879    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  61.38 
 
 		 1233 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  58.34 
 
 		 1208 aa  900    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  81.52 
 
 		 1210 aa  1315    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  52.45 
 
 		 1208 aa  817    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  59.1 
 
 		 1197 aa  921    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  57.8 
 
 		 1209 aa  865    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  55.01 
 
 		 1162 aa  759    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  58.65 
 
 		 1205 aa  878    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  54.56 
 
 		 1179 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  53.29 
 
 		 1206 aa  832    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  53.89 
 
 		 1220 aa  747    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  60.56 
 
 		 1212 aa  967    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  56.01 
 
 		 1207 aa  838    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  55.14 
 
 		 1205 aa  840    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  56.6 
 
 		 1197 aa  860    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  59.18 
 
 		 1209 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  56.1 
 
 		 1176 aa  817    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  58.61 
 
 		 1228 aa  860    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  55.51 
 
 		 1172 aa  848    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  57.64 
 
 		 1209 aa  942    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  56.23 
 
 		 1176 aa  819    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  54.71 
 
 		 1183 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  58.89 
 
 		 1205 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  55.11 
 
 		 1183 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  60.11 
 
 		 1238 aa  865    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  76.26 
 
 		 1200 aa  1175    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  54.52 
 
 		 1182 aa  818    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  56.92 
 
 		 1204 aa  855    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  48.63 
 
 		 1822 aa  742    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  59.26 
 
 		 1205 aa  877    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  54.39 
 
 		 1205 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  56.62 
 
 		 1204 aa  863    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  77.59 
 
 		 1201 aa  1192    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  54.43 
 
 		 1201 aa  788    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  62.77 
 
 		 1200 aa  934    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  54.39 
 
 		 1205 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  55.1 
 
 		 1234 aa  788    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  59.26 
 
 		 1205 aa  877    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1333  pyruvate carboxylase subunit A  45.76 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  45.31 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.32 
 
 		 652 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.21 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.17 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  46.77 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  46.76 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.96 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.38 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1342  pyruvate carboxylase subunit A  45.31 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.492096  normal  0.0929613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  45.31 
 
 		 448 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0611  pyruvate carboxylase subunit A  45.76 
 
 		 497 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.937558  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.72 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.89 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.72 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.24 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.56 
 
 		 446 aa  386  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.97 
 
 		 449 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.59 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2736  biotin carboxylase/biotin-containing subunit  47.94 
 
 		 649 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2467  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  48.97 
 
 		 649 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30197  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.3 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  47.96 
 
 		 661 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.51 
 
 		 671 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03221  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.5 
 
 		 448 aa  383  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.1 
 
 		 445 aa  383  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.66 
 
 		 446 aa  383  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  47.74 
 
 		 661 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0265  acyl-CoA carboxylase subunit alpha  49.22 
 
 		 712 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0063  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.64 
 
 		 448 aa  379  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.278337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1604  carbamoyl-phosphate synthetase large chain  49.08 
 
 		 668 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0456964  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.86 
 
 		 449 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.82 
 
 		 448 aa  379  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2602  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.74 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000536628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1379  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.88 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.85 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.07 
 
 		 671 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1351  pyruvate carboxylase subunit A  44.87 
 
 		 506 aa  379  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.926439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2996  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.01 
 
 		 684 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0153  pyruvate carboxylase subunit A  46.89 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27286  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1455  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.44 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3259  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  46.1 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0256085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.96 
 
 		 673 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0119  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.95 
 
 		 492 aa  380  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.334605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.54 
 
 		 662 aa  380  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>