More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0074 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.54 
 
 		 1241 aa  866    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  60.75 
 
 		 1205 aa  1421    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  57.15 
 
 		 1231 aa  1354    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  57.52 
 
 		 1176 aa  1302    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  58.2 
 
 		 1226 aa  1378    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  54.26 
 
 		 1205 aa  1195    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  54.16 
 
 		 1220 aa  1195    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  57.08 
 
 		 663 aa  746    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  55.49 
 
 		 1162 aa  1172    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  61.26 
 
 		 1488 aa  915    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  63.76 
 
 		 1228 aa  1504    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 1201 aa  2442    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  56.86 
 
 		 1179 aa  1318    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  57.9 
 
 		 1203 aa  1332    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  67.89 
 
 		 1233 aa  1584    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  57.59 
 
 		 677 aa  747    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  58.6 
 
 		 1210 aa  1381    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  57.23 
 
 		 1179 aa  1267    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  58.12 
 
 		 1207 aa  1357    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  57.55 
 
 		 1179 aa  1332    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  57.62 
 
 		 1182 aa  1350    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  54.67 
 
 		 1204 aa  1176    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  56.53 
 
 		 1176 aa  1298    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  59.61 
 
 		 1238 aa  1384    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  56.92 
 
 		 1206 aa  1378    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  63.23 
 
 		 1200 aa  1508    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  56.22 
 
 		 1204 aa  1332    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  63.25 
 
 		 1205 aa  1472    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  64.91 
 
 		 1212 aa  1591    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  54.35 
 
 		 1208 aa  1292    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  63.36 
 
 		 1208 aa  1546    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  55.47 
 
 		 1204 aa  1310    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  56.84 
 
 		 1204 aa  1326    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  58.24 
 
 		 1197 aa  1360    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  57.99 
 
 		 1201 aa  1346    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  58.21 
 
 		 1172 aa  1365    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  52.02 
 
 		 1212 aa  1106    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  56.88 
 
 		 1209 aa  1362    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  56.94 
 
 		 1209 aa  1321    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  59.77 
 
 		 1183 aa  1378    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  63.59 
 
 		 1205 aa  1488    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  57.06 
 
 		 1180 aa  1292    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  57.44 
 
 		 1183 aa  1338    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  62.17 
 
 		 1209 aa  1526    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  63.71 
 
 		 1203 aa  1505    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  63.21 
 
 		 1205 aa  1467    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  63.21 
 
 		 1205 aa  1467    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  54.26 
 
 		 1205 aa  1195    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  55.48 
 
 		 1243 aa  1330    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  66.31 
 
 		 1204 aa  1606    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  58.8 
 
 		 1197 aa  1367    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  69.1 
 
 		 1203 aa  1673    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  54.34 
 
 		 1205 aa  1199    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  53.98 
 
 		 1201 aa  1208    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  47.4 
 
 		 1822 aa  1137    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  58.12 
 
 		 1200 aa  1350    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  55.16 
 
 		 1234 aa  1251    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  50.33 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  51.31 
 
 		 661 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  51.13 
 
 		 673 aa  422  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  50.9 
 
 		 673 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  50.78 
 
 		 450 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0198  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.43 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3403  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.09 
 
 		 696 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.32 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.13 
 
 		 655 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0029  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.99 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00270537  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  45.67 
 
 		 662 aa  419  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.52 
 
 		 448 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0321  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.08 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0373504  normal  0.0139821 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1070  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  48.62 
 
 		 661 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.18 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1600  methylcrotonyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.66 
 
 		 681 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.53 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  49.55 
 
 		 654 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.41 
 
 		 445 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.31 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  45.63 
 
 		 656 aa  414  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.89 
 
 		 667 aa  416  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0644  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.78 
 
 		 448 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1960  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.53 
 
 		 453 aa  415  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00135614  normal  0.658873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0359  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.64 
 
 		 447 aa  415  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.476375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.38 
 
 		 671 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.41 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.18 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1660  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.52 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.84 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.11 
 
 		 670 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.45 
 
 		 446 aa  416  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  51.9 
 
 		 666 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  50.66 
 
 		 661 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2677  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.98 
 
 		 447 aa  412  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.95 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.67 
 
 		 667 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.18 
 
 		 445 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.45 
 
 		 670 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  49.32 
 
 		 654 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.18 
 
 		 445 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.43 
 
 		 655 aa  412  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.77 
 
 		 662 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>