More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2680 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38 
 
 
1241 aa  807    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  50.74 
 
 
1207 aa  1201    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  53.76 
 
 
1176 aa  1237    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  58.1 
 
 
1208 aa  1404    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.76 
 
 
1205 aa  1296    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  71.92 
 
 
1226 aa  1791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.08 
 
 
1179 aa  1231    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  92.65 
 
 
1201 aa  2224    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  51.56 
 
 
1220 aa  1153    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  53.51 
 
 
1179 aa  1204    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.78 
 
 
1179 aa  1226    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  76.26 
 
 
1488 aa  1198    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  58.12 
 
 
1201 aa  1353    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  52.55 
 
 
1205 aa  1152    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  58.77 
 
 
1233 aa  1358    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  51.95 
 
 
663 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  49.67 
 
 
1201 aa  1148    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  73.92 
 
 
1210 aa  1835    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  51.56 
 
 
1204 aa  1201    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  71.86 
 
 
1203 aa  1729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  55.17 
 
 
1172 aa  1298    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  57.43 
 
 
1200 aa  1361    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  53.79 
 
 
1206 aa  1308    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  55.93 
 
 
1209 aa  1328    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  56.94 
 
 
1212 aa  1390    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  58.95 
 
 
1197 aa  1345    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  57.31 
 
 
1205 aa  1321    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  54.8 
 
 
1197 aa  1282    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  52.55 
 
 
1205 aa  1150    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.66 
 
 
1180 aa  1212    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  53.33 
 
 
677 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  57.58 
 
 
1209 aa  1421    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  57.34 
 
 
1205 aa  1323    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  54.05 
 
 
1183 aa  1269    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  57.18 
 
 
1203 aa  1334    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  58.36 
 
 
1203 aa  1381    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  56.72 
 
 
1205 aa  1300    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  100 
 
 
1200 aa  2446    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  53.39 
 
 
1183 aa  1248    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  55.12 
 
 
1228 aa  1281    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  50.33 
 
 
1208 aa  1191    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  55.2 
 
 
1238 aa  1273    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  53.75 
 
 
1182 aa  1279    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  51.06 
 
 
1234 aa  1164    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  47.96 
 
 
1212 aa  1002    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.34 
 
 
1822 aa  1015    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.54 
 
 
1209 aa  1238    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  53.82 
 
 
1176 aa  1232    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  57.31 
 
 
1205 aa  1321    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  52.55 
 
 
1205 aa  1150    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  74.21 
 
 
1231 aa  1816    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  60.33 
 
 
1204 aa  1427    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  52.93 
 
 
1162 aa  1155    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.02 
 
 
1204 aa  1214    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  51.77 
 
 
1204 aa  1124    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  50.68 
 
 
1243 aa  1239    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  51.52 
 
 
1204 aa  1213    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  45.76 
 
 
654 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  47.37 
 
 
447 aa  385  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  48.4 
 
 
661 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  48.4 
 
 
661 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.87 
 
 
446 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1342  pyruvate carboxylase subunit A  43.96 
 
 
494 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.492096  normal  0.0929613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.03 
 
 
686 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  47.02 
 
 
654 aa  383  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1333  pyruvate carboxylase subunit A  43.96 
 
 
497 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.65 
 
 
448 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.37 
 
 
446 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.3 
 
 
671 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.54 
 
 
446 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  44.42 
 
 
498 aa  382  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1351  pyruvate carboxylase subunit A  45.56 
 
 
506 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.926439  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.28 
 
 
667 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  46.79 
 
 
654 aa  379  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.7 
 
 
447 aa  380  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.79 
 
 
445 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.71 
 
 
662 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.43 
 
 
447 aa  380  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  44.77 
 
 
446 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1359  3-methylcrotonyl-CoA carboxylase alpha subunit  47.14 
 
 
673 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.33 
 
 
446 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.69 
 
 
445 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.6 
 
 
655 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2602  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.62 
 
 
447 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000536628  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1604  carbamoyl-phosphate synthetase large chain  48.6 
 
 
668 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0456964  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  46.05 
 
 
673 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.92 
 
 
448 aa  376  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.43 
 
 
733 aa  376  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.48 
 
 
734 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.31 
 
 
652 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0611  pyruvate carboxylase subunit A  43.51 
 
 
497 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.937558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.7 
 
 
447 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1039  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.79 
 
 
447 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0175  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.47 
 
 
449 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.59 
 
 
670 aa  376  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.47 
 
 
447 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1660  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.76 
 
 
445 aa  377  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1065  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.17 
 
 
448 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000015139  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  43.53 
 
 
448 aa  373  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03221  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.24 
 
 
448 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>