More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1105 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.36 
 
 		 1241 aa  857    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  49.88 
 
 		 1231 aa  1160    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  46.63 
 
 		 1162 aa  1014    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  49.72 
 
 		 1226 aa  1177    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  50.62 
 
 		 1205 aa  1105    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  59.83 
 
 		 1207 aa  1450    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  52.45 
 
 		 1488 aa  817    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  54.35 
 
 		 1201 aa  1264    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  49.17 
 
 		 1204 aa  1051    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  54.48 
 
 		 1203 aa  1303    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  54.07 
 
 		 1233 aa  1271    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  48.6 
 
 		 677 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  51.61 
 
 		 1203 aa  1211    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  50.33 
 
 		 1200 aa  1173    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  50.25 
 
 		 1210 aa  1174    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  51.5 
 
 		 1179 aa  1139    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  51.79 
 
 		 1172 aa  1201    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  59.32 
 
 		 1209 aa  1447    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  51.16 
 
 		 1206 aa  1251    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  47.7 
 
 		 1212 aa  1025    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  53 
 
 		 1212 aa  1285    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  52.12 
 
 		 1205 aa  1213    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  52.15 
 
 		 1238 aa  1194    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  53.85 
 
 		 1200 aa  1267    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  51.75 
 
 		 1197 aa  1214    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  48.37 
 
 		 1243 aa  1151    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  52.48 
 
 		 1204 aa  1263    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  51 
 
 		 1180 aa  1129    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  50.45 
 
 		 1209 aa  1190    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  52.75 
 
 		 1209 aa  1267    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  51.29 
 
 		 1183 aa  1192    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  50.91 
 
 		 1203 aa  1168    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  51.36 
 
 		 1205 aa  1193    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  51 
 
 		 1183 aa  1179    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  59.26 
 
 		 1204 aa  1447    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  52.52 
 
 		 1208 aa  1264    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  50.87 
 
 		 1182 aa  1193    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  51.66 
 
 		 1205 aa  1204    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  50.62 
 
 		 1205 aa  1106    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  100 
 
 		 1208 aa  2476    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  52.78 
 
 		 1228 aa  1228    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  51.37 
 
 		 1176 aa  1161    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  52.68 
 
 		 1197 aa  1238    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  58.96 
 
 		 1204 aa  1432    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  48.3 
 
 		 1201 aa  1102    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  51.87 
 
 		 1176 aa  1167    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  51.42 
 
 		 1179 aa  1183    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  49.06 
 
 		 1234 aa  1131    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  51.08 
 
 		 1822 aa  1228    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  51.66 
 
 		 1205 aa  1204    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  51.53 
 
 		 1205 aa  1202    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  59.42 
 
 		 1204 aa  1454    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  50.54 
 
 		 1201 aa  1158    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  51.99 
 
 		 1179 aa  1186    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  50.62 
 
 		 1205 aa  1106    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  47.47 
 
 		 1220 aa  1041    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  47.95 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.32 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.83 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.93 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.93 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.31 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.7 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.7 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.7 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.25 
 
 		 665 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.7 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.7 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.84 
 
 		 450 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.48 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.48 
 
 		 445 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2677  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.02 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0025  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.31 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0029  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.7 
 
 		 450 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00270537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3760  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  46.85 
 
 		 662 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1960  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.02 
 
 		 453 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00135614  normal  0.658873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  47.22 
 
 		 643 aa  390  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0123  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  47.95 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  decreased coverage  0.00258853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.24 
 
 		 448 aa  390  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.47 
 
 		 448 aa  389  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0198  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.34 
 
 		 447 aa  386  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1017  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.61 
 
 		 675 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.848501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.57 
 
 		 447 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0164  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  48.11 
 
 		 662 aa  386  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0644  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.02 
 
 		 448 aa  383  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2131  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.1 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.83 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0359  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.34 
 
 		 447 aa  382  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.476375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8318  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.99 
 
 		 443 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2167  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.53 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  43.19 
 
 		 670 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6412  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.43 
 
 		 656 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792756  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2379  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.66 
 
 		 682 aa  379  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1325  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.16 
 
 		 602 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0321  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.32 
 
 		 447 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0373504  normal  0.0139821 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.95 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0153  pyruvate carboxylase subunit A  46.09 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27286  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1289  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 602 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0751  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.2 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1306  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.16 
 
 		 602 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0707012  normal  0.142834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>