More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3089 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.46 
 
 		 1241 aa  867    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  56.23 
 
 		 1180 aa  1320    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  54.11 
 
 		 1204 aa  1183    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  56.1 
 
 		 1204 aa  1335    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  70.32 
 
 		 1208 aa  1746    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  59.69 
 
 		 1226 aa  1425    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  54.6 
 
 		 1243 aa  1354    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  59.75 
 
 		 1205 aa  1442    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  57.15 
 
 		 1179 aa  1297    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  62.23 
 
 		 1488 aa  955    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  55.21 
 
 		 1207 aa  1311    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  66.31 
 
 		 1201 aa  1578    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  64.21 
 
 		 1203 aa  1547    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  64.46 
 
 		 1209 aa  1590    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  54.18 
 
 		 1201 aa  1263    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  56.6 
 
 		 1179 aa  1350    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  63.78 
 
 		 1233 aa  1490    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  53.41 
 
 		 1220 aa  1212    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  60.64 
 
 		 1210 aa  1456    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  55 
 
 		 1205 aa  1231    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  59.06 
 
 		 1197 aa  1377    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  46.41 
 
 		 1822 aa  1121    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  56.63 
 
 		 677 aa  734    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  59.01 
 
 		 1206 aa  1457    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  64.46 
 
 		 1212 aa  1595    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  62.07 
 
 		 1205 aa  1481    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  54.52 
 
 		 663 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  60.25 
 
 		 1228 aa  1417    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  56.67 
 
 		 1197 aa  1346    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  100 
 
 		 1204 aa  2464    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  61.87 
 
 		 1203 aa  1504    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  61.76 
 
 		 1205 aa  1476    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  60.33 
 
 		 1200 aa  1400    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  55.75 
 
 		 1209 aa  1313    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  57.34 
 
 		 1209 aa  1393    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  56.95 
 
 		 1182 aa  1365    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  57.07 
 
 		 1183 aa  1359    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  59.39 
 
 		 1231 aa  1403    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  54.67 
 
 		 1162 aa  1192    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  54.98 
 
 		 1234 aa  1276    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  62.54 
 
 		 1205 aa  1493    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  60.15 
 
 		 1203 aa  1388    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  56.69 
 
 		 1204 aa  1353    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  56.19 
 
 		 1183 aa  1343    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  64.76 
 
 		 1200 aa  1570    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  50.78 
 
 		 1212 aa  1095    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  57.07 
 
 		 1179 aa  1359    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  56.75 
 
 		 1204 aa  1334    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  60.65 
 
 		 1201 aa  1392    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  56.37 
 
 		 1176 aa  1320    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  55 
 
 		 1205 aa  1234    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  61.76 
 
 		 1205 aa  1476    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  55 
 
 		 1205 aa  1231    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  59.52 
 
 		 1172 aa  1404    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  59.25 
 
 		 1238 aa  1377    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  52.48 
 
 		 1208 aa  1263    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  56.47 
 
 		 1176 aa  1314    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.06 
 
 		 670 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.32 
 
 		 450 aa  426  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.74 
 
 		 445 aa  423  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.83 
 
 		 445 aa  416  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  415  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  416  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  416  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0716  hypothetical protein  47.68 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.404777 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  50.78 
 
 		 666 aa  416  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.06 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.61 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.76 
 
 		 447 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.89 
 
 		 667 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  47.99 
 
 		 686 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.76 
 
 		 448 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  49.1 
 
 		 654 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  47.09 
 
 		 656 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  51.97 
 
 		 662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  50.22 
 
 		 661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.32 
 
 		 655 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.89 
 
 		 670 aa  410  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.64 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.78 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.42 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.78 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1855  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.25 
 
 		 666 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.4 
 
 		 446 aa  406  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2677  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.76 
 
 		 447 aa  405  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.53 
 
 		 678 aa  405  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1065  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.75 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000015139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.88 
 
 		 667 aa  406  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1826  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.64 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.87 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.1 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.77 
 
 		 671 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  47.64 
 
 		 446 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1016  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.52 
 
 		 446 aa  403  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000161184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.03 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  49.78 
 
 		 661 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>