More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3669 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  37.9 
 
 		 1241 aa  813    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  50.33 
 
 		 1204 aa  1164    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  53.87 
 
 		 1205 aa  1253    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  66.12 
 
 		 677 aa  882    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  63.11 
 
 		 1204 aa  1383    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  59.42 
 
 		 1212 aa  1285    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  51.22 
 
 		 1200 aa  1186    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  53.83 
 
 		 1176 aa  1199    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  66.27 
 
 		 663 aa  863    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  53.32 
 
 		 1226 aa  1224    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  51.06 
 
 		 1201 aa  1168    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  52.05 
 
 		 1203 aa  1154    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  55.2 
 
 		 1203 aa  1270    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  49.3 
 
 		 1208 aa  1162    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  49.88 
 
 		 1209 aa  1129    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  55.1 
 
 		 1488 aa  820    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  55.16 
 
 		 1201 aa  1256    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  49.71 
 
 		 1201 aa  1085    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  54.98 
 
 		 1238 aa  1224    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  54.34 
 
 		 1233 aa  1246    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  52.96 
 
 		 1228 aa  1216    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  53.51 
 
 		 1200 aa  1240    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  53.09 
 
 		 1210 aa  1217    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  69.43 
 
 		 1205 aa  1587    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  54.6 
 
 		 1209 aa  1287    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  54.96 
 
 		 1204 aa  1313    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  50.24 
 
 		 1162 aa  1042    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  52.98 
 
 		 1197 aa  1194    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  44.2 
 
 		 1822 aa  1040    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  52.35 
 
 		 1179 aa  1201    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  49.26 
 
 		 1206 aa  1189    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  49.88 
 
 		 1204 aa  1139    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  52 
 
 		 1212 aa  1252    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  69.43 
 
 		 1205 aa  1587    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  54.56 
 
 		 1197 aa  1262    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  53.87 
 
 		 1208 aa  1281    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  51.4 
 
 		 1243 aa  1212    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  54.58 
 
 		 1205 aa  1268    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  49.15 
 
 		 1209 aa  1155    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  52.83 
 
 		 1183 aa  1210    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  60.69 
 
 		 1220 aa  1385    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  51.43 
 
 		 1207 aa  1168    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  53.67 
 
 		 1205 aa  1242    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  51.76 
 
 		 1183 aa  1184    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  53.76 
 
 		 1179 aa  1164    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  53.41 
 
 		 1182 aa  1228    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  52.13 
 
 		 1172 aa  1197    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.38 
 
 		 1179 aa  1201    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  50.25 
 
 		 1204 aa  1158    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  54.73 
 
 		 1205 aa  1266    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  69.43 
 
 		 1205 aa  1587    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.42 
 
 		 1180 aa  1175    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  53.99 
 
 		 1176 aa  1209    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 1234 aa  2465    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  54.08 
 
 		 1203 aa  1263    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  54.73 
 
 		 1205 aa  1266    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  53.14 
 
 		 1231 aa  1201    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  45.64 
 
 		 733 aa  395  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  50 
 
 		 643 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3536  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  44.84 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06950  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  50.47 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.414561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.71 
 
 		 734 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5568  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.52 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  47.98 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64110  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.52 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.35 
 
 		 652 aa  389  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2809  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.33 
 
 		 670 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.978814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2124  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.32 
 
 		 666 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494302  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.91 
 
 		 665 aa  386  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1604  carbamoyl-phosphate synthetase large chain  48.65 
 
 		 668 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0456964  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0618  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.55 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00922259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.65 
 
 		 671 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.66 
 
 		 654 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0350  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.66 
 
 		 679 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2535  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.66 
 
 		 671 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0007  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.59 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2736  biotin carboxylase/biotin-containing subunit  49.18 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3032  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.54 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.153065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  44.03 
 
 		 654 aa  379  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4401  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.66 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3259  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  45.45 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0256085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0713  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.87 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.6 
 
 		 673 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3292  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.88 
 
 		 668 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1379  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.28 
 
 		 453 aa  380  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.27 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.79 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2694  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.55 
 
 		 661 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250479  normal  0.322946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.94 
 
 		 676 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2274  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.07 
 
 		 459 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0319  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.17 
 
 		 689 aa  380  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.6 
 
 		 670 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.99 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0368  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.54 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2622  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.31 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.592732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.94 
 
 		 671 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0603  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.62 
 
 		 451 aa  377  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0615943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4861  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.9 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4607  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.62 
 
 		 451 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2479  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.55 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>