More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2393 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.25 
 
 		 1241 aa  807    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  52.63 
 
 		 1205 aa  1153    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  51.97 
 
 		 1204 aa  1216    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  54.09 
 
 		 1176 aa  1230    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.87 
 
 		 1205 aa  1293    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  72.57 
 
 		 1226 aa  1803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  92.65 
 
 		 1200 aa  2240    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.91 
 
 		 1179 aa  1226    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  55.01 
 
 		 1172 aa  1291    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  77.21 
 
 		 1488 aa  1217    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  58.07 
 
 		 1201 aa  1348    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  59.65 
 
 		 1233 aa  1372    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  72.38 
 
 		 1203 aa  1730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  54.11 
 
 		 1182 aa  1288    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  57.65 
 
 		 1205 aa  1317    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  48.77 
 
 		 1212 aa  1006    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  74.83 
 
 		 1210 aa  1844    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  56.26 
 
 		 1209 aa  1324    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  60.65 
 
 		 1204 aa  1424    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  49.88 
 
 		 1201 aa  1155    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  55.43 
 
 		 1238 aa  1276    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  51.97 
 
 		 1204 aa  1216    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.73 
 
 		 1822 aa  1021    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  53.99 
 
 		 1206 aa  1311    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.17 
 
 		 1220 aa  1154    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  51.52 
 
 		 1204 aa  1116    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  57.44 
 
 		 1203 aa  1333    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  56.81 
 
 		 1212 aa  1387    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  74.53 
 
 		 1231 aa  1815    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  58.12 
 
 		 1200 aa  1363    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  54.97 
 
 		 1197 aa  1283    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  53 
 
 		 1180 aa  1216    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  55.78 
 
 		 1228 aa  1281    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  58.48 
 
 		 1208 aa  1399    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  53.26 
 
 		 1162 aa  1157    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  57.57 
 
 		 1209 aa  1413    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  53.63 
 
 		 677 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  53.91 
 
 		 1183 aa  1270    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  59.44 
 
 		 1197 aa  1353    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.43 
 
 		 1204 aa  1221    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  57.72 
 
 		 1205 aa  1300    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  53.7 
 
 		 1183 aa  1251    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  50.54 
 
 		 1208 aa  1188    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.62 
 
 		 1209 aa  1236    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  50.55 
 
 		 1243 aa  1208    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  54.09 
 
 		 1176 aa  1233    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.25 
 
 		 1179 aa  1243    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  52.63 
 
 		 1205 aa  1156    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  57.65 
 
 		 1205 aa  1317    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  52.63 
 
 		 1205 aa  1153    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  100 
 
 		 1201 aa  2442    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  58.01 
 
 		 1205 aa  1323    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  52.33 
 
 		 663 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  58.9 
 
 		 1203 aa  1386    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  51.02 
 
 		 1234 aa  1160    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  51.23 
 
 		 1207 aa  1206    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  54.33 
 
 		 1179 aa  1197    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  44.52 
 
 		 498 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.44 
 
 		 448 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  48.33 
 
 		 447 aa  392  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  49.1 
 
 		 661 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  46.98 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1333  pyruvate carboxylase subunit A  44.07 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  46.76 
 
 		 654 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.89 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1342  pyruvate carboxylase subunit A  44.3 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.492096  normal  0.0929613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.69 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  48.64 
 
 		 661 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.42 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1618  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.27 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.13 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.53 
 
 		 671 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0153  pyruvate carboxylase subunit A  47.79 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27286  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.47 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1585  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.27 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.53 
 
 		 652 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.25 
 
 		 446 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1087  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.69 
 
 		 452 aa  379  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  46.62 
 
 		 673 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  46.62 
 
 		 673 aa  379  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03803  biotin carboxylase  49.32 
 
 		 675 aa  379  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.2 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  42.98 
 
 		 656 aa  378  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1359  3-methylcrotonyl-CoA carboxylase alpha subunit  45.7 
 
 		 673 aa  380  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  44.25 
 
 		 446 aa  380  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2677  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.92 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0611  pyruvate carboxylase subunit A  43.85 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.937558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1660  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.98 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  45.58 
 
 		 686 aa  380  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.95 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1351  pyruvate carboxylase subunit A  45.19 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.926439  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.14 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1006  pyruvate carboxylase subunit A  43.85 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  40.75 
 
 		 666 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0175  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.11 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2602  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.17 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000536628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.14 
 
 		 447 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.42 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  44.55 
 
 		 665 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0962  biotin carboxylase  43.4 
 
 		 661 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>