More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3728 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.09 
 
 		 1241 aa  792    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  51.31 
 
 		 1172 aa  1155    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  63.08 
 
 		 1205 aa  1387    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  48.94 
 
 		 1204 aa  1096    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.09 
 
 		 1180 aa  1155    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  50.6 
 
 		 1226 aa  1177    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  52.45 
 
 		 1179 aa  1186    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  48.7 
 
 		 1201 aa  1068    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  53.46 
 
 		 1182 aa  1219    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  62.56 
 
 		 663 aa  813    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  53.89 
 
 		 1488 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  54.24 
 
 		 1201 aa  1212    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  52.64 
 
 		 1238 aa  1175    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  49.43 
 
 		 1209 aa  1102    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  54.27 
 
 		 1233 aa  1191    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  61.5 
 
 		 677 aa  796    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  52.4 
 
 		 1197 aa  1173    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  51.04 
 
 		 1210 aa  1176    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  52.79 
 
 		 1162 aa  1082    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  100 
 
 		 1220 aa  2422    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  52.79 
 
 		 1228 aa  1174    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  47.85 
 
 		 1206 aa  1156    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  54.23 
 
 		 1243 aa  808    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  52.32 
 
 		 1212 aa  1237    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  51.96 
 
 		 1200 aa  1165    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  48.35 
 
 		 1207 aa  1094    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  52.9 
 
 		 1197 aa  1190    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  51.87 
 
 		 1201 aa  1159    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  49.35 
 
 		 1209 aa  1154    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  54.19 
 
 		 1176 aa  1178    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  53.53 
 
 		 1179 aa  1135    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  53.66 
 
 		 1183 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  48.87 
 
 		 1204 aa  1109    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  53.82 
 
 		 1203 aa  1202    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  54.31 
 
 		 1205 aa  1192    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.83 
 
 		 1179 aa  1177    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  52.26 
 
 		 1183 aa  1192    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  54.15 
 
 		 1203 aa  1220    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  54.96 
 
 		 1205 aa  1199    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  52.32 
 
 		 1208 aa  1226    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  63.08 
 
 		 1205 aa  1389    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  53.38 
 
 		 1209 aa  1263    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  54.94 
 
 		 1205 aa  1193    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  63.08 
 
 		 1205 aa  1387    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  53.66 
 
 		 1204 aa  1253    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  56.74 
 
 		 1212 aa  1168    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  52.97 
 
 		 1200 aa  1197    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  47.55 
 
 		 1208 aa  1076    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  50.4 
 
 		 1231 aa  1144    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  54.23 
 
 		 1176 aa  1172    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  72.16 
 
 		 1204 aa  1610    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  53.64 
 
 		 1205 aa  1236    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  49.51 
 
 		 1204 aa  1127    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  61.17 
 
 		 1234 aa  1407    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  54.94 
 
 		 1205 aa  1193    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  52.58 
 
 		 1203 aa  1158    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.67 
 
 		 1822 aa  1017    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.85 
 
 		 686 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.12 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0007  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.05 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2809  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.67 
 
 		 670 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.978814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  45.32 
 
 		 654 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  45.32 
 
 		 654 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.19 
 
 		 667 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.33 
 
 		 673 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3536  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  42.47 
 
 		 517 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.78 
 
 		 667 aa  365  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0350  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49 
 
 		 679 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2535  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49 
 
 		 671 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.67 
 
 		 667 aa  365  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.67 
 
 		 667 aa  365  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4551  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.54 
 
 		 633 aa  363  8e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.68 
 
 		 671 aa  363  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.41 
 
 		 676 aa  363  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05850  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.98 
 
 		 591 aa  362  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.83 
 
 		 666 aa  362  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.21 
 
 		 671 aa  361  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.12 
 
 		 450 aa  361  6e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  47.83 
 
 		 695 aa  360  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.55 
 
 		 666 aa  360  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2694  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.3 
 
 		 661 aa  360  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250479  normal  0.322946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.84 
 
 		 652 aa  360  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  48.82 
 
 		 643 aa  360  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2750  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.27 
 
 		 667 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0185011  normal  0.216435 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.37 
 
 		 670 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0319  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.13 
 
 		 689 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3221  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.77 
 
 		 667 aa  357  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.390977 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  47.33 
 
 		 666 aa  357  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0164  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  48.17 
 
 		 662 aa  357  8.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0782  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  47.31 
 
 		 582 aa  356  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.742429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3684  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  44.99 
 
 		 685 aa  356  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.82326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2996  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.68 
 
 		 684 aa  356  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2167  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.24 
 
 		 682 aa  355  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2165  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.11 
 
 		 671 aa  355  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0052  biotin carboxylase  47.34 
 
 		 662 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  43.27 
 
 		 655 aa  355  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.12 
 
 		 682 aa  355  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.76 
 
 		 671 aa  354  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0434  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.96 
 
 		 659 aa  354  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1736  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  48.67 
 
 		 671 aa  353  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.124901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>