More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0904 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.05 
 
 		 1241 aa  812    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  55.11 
 
 		 1205 aa  1197    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  51.77 
 
 		 1200 aa  1177    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  64.38 
 
 		 1205 aa  1391    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  53.11 
 
 		 1226 aa  1217    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  62.84 
 
 		 677 aa  812    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  53.11 
 
 		 1197 aa  1178    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  52.04 
 
 		 1243 aa  1224    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  54.11 
 
 		 1203 aa  1222    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  55.16 
 
 		 1488 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  54.67 
 
 		 1201 aa  1216    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  50.53 
 
 		 1204 aa  1182    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  55.11 
 
 		 1233 aa  1211    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  54.35 
 
 		 1179 aa  1211    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  53.06 
 
 		 1182 aa  1188    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  53.84 
 
 		 1180 aa  1175    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  52.76 
 
 		 1210 aa  1206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  48.3 
 
 		 1201 aa  1045    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  49.84 
 
 		 1207 aa  1134    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  52.98 
 
 		 1162 aa  1073    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  51.94 
 
 		 1208 aa  1209    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  50.62 
 
 		 1204 aa  1132    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  48.51 
 
 		 1206 aa  1149    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.28 
 
 		 1822 aa  1021    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  52.56 
 
 		 1212 aa  1256    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  100 
 
 		 1204 aa  2362    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  51.92 
 
 		 1209 aa  1170    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  53.52 
 
 		 1200 aa  1205    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  51.83 
 
 		 1228 aa  1161    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  61.72 
 
 		 663 aa  783    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  53.05 
 
 		 1197 aa  1180    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.71 
 
 		 1179 aa  1199    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  50.41 
 
 		 1209 aa  1178    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  53.32 
 
 		 1238 aa  1166    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  53.88 
 
 		 1183 aa  1204    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  54.05 
 
 		 1203 aa  1180    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.83 
 
 		 1205 aa  1246    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  52.73 
 
 		 1172 aa  1174    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  53.85 
 
 		 1205 aa  1209    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  52.13 
 
 		 1183 aa  1161    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  64.38 
 
 		 1205 aa  1391    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  54.11 
 
 		 1204 aa  1257    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  49.17 
 
 		 1208 aa  1119    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  55.12 
 
 		 1205 aa  1195    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  64.38 
 
 		 1205 aa  1391    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  51.6 
 
 		 1201 aa  1168    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  55 
 
 		 1209 aa  1294    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  54.94 
 
 		 1203 aa  1221    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  53.63 
 
 		 1231 aa  1204    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  55.42 
 
 		 1176 aa  1185    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.19 
 
 		 1204 aa  1207    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  54.91 
 
 		 1179 aa  1148    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  72.16 
 
 		 1220 aa  1628    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  62.69 
 
 		 1212 aa  1259    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  62.94 
 
 		 1234 aa  1422    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  55.12 
 
 		 1205 aa  1195    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  55.46 
 
 		 1176 aa  1177    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  52.55 
 
 		 665 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2809  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  53.2 
 
 		 670 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.978814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.15 
 
 		 448 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.56 
 
 		 734 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0007  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.39 
 
 		 465 aa  383  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1473  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  54.04 
 
 		 666 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.6 
 
 		 752 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.47 
 
 		 447 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0164  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  49.36 
 
 		 662 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  44.89 
 
 		 686 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  49.79 
 
 		 654 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0350  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.72 
 
 		 679 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2535  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.72 
 
 		 671 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.89 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2933  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.57 
 
 		 671 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.55 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2781  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.03 
 
 		 667 aa  373  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940378  normal  0.476201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.66 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.37 
 
 		 450 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0716  hypothetical protein  42.25 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.404777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  50.87 
 
 		 643 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.67 
 
 		 660 aa  367  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.6 
 
 		 673 aa  365  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4551  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.09 
 
 		 633 aa  366  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.29 
 
 		 667 aa  365  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0153  pyruvate carboxylase subunit A  46.21 
 
 		 518 aa  365  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27286  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  42.86 
 
 		 498 aa  364  4e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.63 
 
 		 449 aa  364  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 662 aa  364  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0319  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  44.4 
 
 		 689 aa  364  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.12 
 
 		 662 aa  364  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.48 
 
 		 681 aa  364  7.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0352  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.04 
 
 		 456 aa  363  8e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2694  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.22 
 
 		 661 aa  363  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250479  normal  0.322946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.83 
 
 		 667 aa  363  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.4 
 
 		 449 aa  363  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.12 
 
 		 662 aa  363  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3819  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.25 
 
 		 446 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000013347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.46 
 
 		 666 aa  363  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33770  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.44 
 
 		 467 aa  363  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.86 
 
 		 445 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.61 
 
 		 667 aa  362  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.17 
 
 		 448 aa  362  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>