More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1384 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.19 
 
 		 1241 aa  860    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  64.05 
 
 		 1208 aa  1536    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  57.35 
 
 		 1179 aa  1331    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  54.17 
 
 		 1220 aa  1186    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  53.33 
 
 		 1204 aa  1255    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  62 
 
 		 1203 aa  1477    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  56.18 
 
 		 1226 aa  1325    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  57.21 
 
 		 1180 aa  1307    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  81.21 
 
 		 1205 aa  1941    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  58.38 
 
 		 1238 aa  1367    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  52.66 
 
 		 1201 aa  1219    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  56.62 
 
 		 1179 aa  1312    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  58.31 
 
 		 1203 aa  1324    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  59.03 
 
 		 1488 aa  885    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  63.84 
 
 		 1201 aa  1494    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  58.99 
 
 		 1228 aa  1379    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  58.94 
 
 		 663 aa  750    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  59.62 
 
 		 1243 aa  890    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  61.09 
 
 		 1233 aa  1409    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  58.91 
 
 		 1197 aa  1361    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  57.86 
 
 		 1210 aa  1354    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51.53 
 
 		 1208 aa  1214    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  58.75 
 
 		 1176 aa  1344    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  57.39 
 
 		 1201 aa  1312    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  56.97 
 
 		 1200 aa  1307    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  54.51 
 
 		 1204 aa  1172    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  58.98 
 
 		 1176 aa  1341    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  55.02 
 
 		 1206 aa  1353    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  62.93 
 
 		 1212 aa  1551    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  62.79 
 
 		 1204 aa  1518    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  57.49 
 
 		 1162 aa  1215    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  61.81 
 
 		 1200 aa  1472    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  58.47 
 
 		 1182 aa  1365    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  53.63 
 
 		 1207 aa  1256    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  56.51 
 
 		 1197 aa  1335    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  57.23 
 
 		 1205 aa  1240    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  53.75 
 
 		 1234 aa  1233    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  56.48 
 
 		 1209 aa  1351    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  81.21 
 
 		 1205 aa  1941    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  58.42 
 
 		 1183 aa  1368    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  58.45 
 
 		 1172 aa  1358    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  53.55 
 
 		 1204 aa  1231    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  54.34 
 
 		 1209 aa  1280    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  100 
 
 		 1205 aa  2452    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  59.02 
 
 		 1179 aa  1309    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  57.55 
 
 		 1183 aa  1338    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  56.42 
 
 		 1231 aa  1306    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  94.7 
 
 		 1203 aa  2305    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  61.51 
 
 		 1209 aa  1498    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  57.31 
 
 		 1205 aa  1244    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  52.88 
 
 		 1204 aa  1236    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  81.21 
 
 		 1205 aa  1941    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  57.23 
 
 		 1205 aa  1240    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  58.05 
 
 		 677 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  52.64 
 
 		 1212 aa  1073    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  44.65 
 
 		 1822 aa  1056    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  59.37 
 
 		 1205 aa  1397    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.78 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1379  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.44 
 
 		 453 aa  412  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1855  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.98 
 
 		 666 aa  412  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  48.88 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.48 
 
 		 681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  51.11 
 
 		 666 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.22 
 
 		 655 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.43 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  45.18 
 
 		 656 aa  404  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.66 
 
 		 671 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  51.89 
 
 		 661 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.2 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.55 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.98 
 
 		 652 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  43.31 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.77 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2677  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.64 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.43 
 
 		 448 aa  403  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  48.78 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1147  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  52.48 
 
 		 667 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.221564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.7 
 
 		 680 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.77 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  51.89 
 
 		 661 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.41 
 
 		 447 aa  400  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.99 
 
 		 446 aa  399  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.76 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0359  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.86 
 
 		 447 aa  399  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.476375  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.1 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.17 
 
 		 449 aa  400  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.17 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0153  pyruvate carboxylase subunit A  50.67 
 
 		 518 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27286  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.94 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50 
 
 		 667 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.77 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.76 
 
 		 655 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1826  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.43 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.72 
 
 		 449 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1039  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.08 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.44 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.54 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2694  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.35 
 
 		 661 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250479  normal  0.322946 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.67 
 
 		 667 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.26 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>