More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1892 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.55 
 
 		 1241 aa  860    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  61.99 
 
 		 1182 aa  1473    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  60.87 
 
 		 1179 aa  1446    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  57.78 
 
 		 1162 aa  1258    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  100 
 
 		 1205 aa  2441    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  54.79 
 
 		 1201 aa  1275    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  54.49 
 
 		 1226 aa  1297    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  54.68 
 
 		 1231 aa  1308    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  60.1 
 
 		 1180 aa  1397    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  55.14 
 
 		 1488 aa  840    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  60.75 
 
 		 1201 aa  1390    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  51.16 
 
 		 1201 aa  1185    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  59.85 
 
 		 1233 aa  1373    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  56.48 
 
 		 677 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  54.77 
 
 		 1203 aa  1290    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  59.75 
 
 		 1204 aa  1442    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  55.07 
 
 		 1210 aa  1311    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  59.47 
 
 		 1203 aa  1400    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  60.62 
 
 		 1179 aa  1438    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  53.79 
 
 		 1234 aa  1214    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  56.18 
 
 		 1238 aa  1300    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  54.71 
 
 		 1204 aa  1271    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  53.53 
 
 		 1206 aa  1305    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  60.45 
 
 		 1203 aa  1436    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  58.3 
 
 		 1212 aa  1417    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  58.39 
 
 		 1243 aa  1427    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  51.16 
 
 		 1212 aa  1066    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  54.83 
 
 		 1205 aa  1221    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  46.92 
 
 		 1822 aa  1111    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  61.44 
 
 		 1176 aa  1414    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  61.53 
 
 		 1179 aa  1386    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  54.2 
 
 		 1197 aa  1271    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  54.76 
 
 		 1200 aa  1285    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  53.64 
 
 		 1204 aa  1285    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  59.15 
 
 		 1205 aa  1359    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  58.55 
 
 		 1208 aa  1423    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  59.97 
 
 		 1209 aa  1439    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  54.66 
 
 		 1205 aa  1219    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  54.95 
 
 		 1209 aa  1364    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  59.06 
 
 		 1205 aa  1358    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  61.19 
 
 		 1176 aa  1419    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  61.26 
 
 		 1183 aa  1443    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  54.83 
 
 		 1204 aa  1179    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  59.12 
 
 		 1205 aa  1365    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  61.79 
 
 		 1183 aa  1454    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  54.04 
 
 		 1204 aa  1293    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  54.84 
 
 		 1207 aa  1274    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  53.57 
 
 		 1220 aa  1202    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  59.52 
 
 		 1200 aa  1403    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  57.23 
 
 		 1197 aa  1325    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  59.06 
 
 		 1205 aa  1358    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  54.66 
 
 		 1205 aa  1219    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  54.55 
 
 		 663 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  54.81 
 
 		 1209 aa  1285    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  52.12 
 
 		 1208 aa  1213    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  57.12 
 
 		 1228 aa  1348    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  60.85 
 
 		 1172 aa  1454    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.42 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.75 
 
 		 445 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.95 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.05 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.05 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.05 
 
 		 445 aa  416  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.05 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  51.21 
 
 		 673 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  50.99 
 
 		 673 aa  412  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.82 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.82 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.82 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.82 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.82 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  47.49 
 
 		 686 aa  410  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  50.11 
 
 		 661 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  50.11 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.77 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50 
 
 		 655 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  48.09 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.43 
 
 		 665 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.32 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.93 
 
 		 446 aa  396  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  44.99 
 
 		 656 aa  394  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1379  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.79 
 
 		 453 aa  396  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  49.22 
 
 		 666 aa  396  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.97 
 
 		 671 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.77 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.22 
 
 		 670 aa  396  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.4 
 
 		 681 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.99 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.55 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  46.44 
 
 		 654 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  48.32 
 
 		 695 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.32 
 
 		 666 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.09 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.59 
 
 		 673 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.450975  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1147  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.89 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.221564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.15 
 
 		 676 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0319  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.27 
 
 		 689 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01970  biotin carboxylase /acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  46.21 
 
 		 449 aa  392  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.772164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.32 
 
 		 666 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.64 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>