More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6105 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  37.71 
 
 		 1241 aa  783    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  53.96 
 
 		 1209 aa  1247    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  53.29 
 
 		 1197 aa  1224    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  54.86 
 
 		 677 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  71.67 
 
 		 1182 aa  1721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  100 
 
 		 1179 aa  2392    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  52.81 
 
 		 1226 aa  1242    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  52.77 
 
 		 1204 aa  1236    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  56.21 
 
 		 1208 aa  1348    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  53.84 
 
 		 1203 aa  1222    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  63.86 
 
 		 1172 aa  1512    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  60.87 
 
 		 1205 aa  1446    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  55.09 
 
 		 1488 aa  818    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  57.55 
 
 		 1201 aa  1297    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  58.22 
 
 		 1209 aa  1362    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  52.61 
 
 		 1201 aa  1195    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  57.07 
 
 		 1233 aa  1323    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  56.6 
 
 		 1204 aa  1350    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  56.64 
 
 		 1238 aa  1275    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  77.03 
 
 		 1180 aa  1805    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  53.88 
 
 		 1210 aa  1262    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  60.85 
 
 		 1162 aa  1312    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  56.98 
 
 		 1203 aa  1331    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  53.67 
 
 		 1204 aa  1263    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  54.64 
 
 		 1205 aa  1182    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  54.64 
 
 		 1205 aa  1183    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51.99 
 
 		 1208 aa  1186    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  75.72 
 
 		 1176 aa  1776    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.86 
 
 		 1206 aa  1276    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  52.93 
 
 		 1204 aa  1196    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  53.71 
 
 		 1207 aa  1237    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  55.45 
 
 		 1212 aa  1331    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  49.88 
 
 		 1212 aa  1014    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.71 
 
 		 1204 aa  1135    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  55.01 
 
 		 1197 aa  1285    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  56.06 
 
 		 1200 aa  1306    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  94.4 
 
 		 1179 aa  2265    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  53.08 
 
 		 1200 aa  1217    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  53.35 
 
 		 1209 aa  1256    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  75.13 
 
 		 1179 aa  1732    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  71.34 
 
 		 1183 aa  1716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  57.11 
 
 		 1205 aa  1296    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  70.87 
 
 		 1183 aa  1703    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  53.61 
 
 		 1231 aa  1252    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  58.17 
 
 		 1205 aa  1339    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  75.38 
 
 		 1176 aa  1768    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  58.11 
 
 		 1205 aa  1341    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  54.64 
 
 		 1205 aa  1182    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  48.05 
 
 		 1822 aa  1092    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  69.8 
 
 		 1243 aa  1689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  53.25 
 
 		 1201 aa  1228    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  57.39 
 
 		 1203 aa  1343    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  51.75 
 
 		 663 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  52.47 
 
 		 1234 aa  1161    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  58.11 
 
 		 1205 aa  1341    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  55.03 
 
 		 1228 aa  1278    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.45 
 
 		 1220 aa  1156    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  53.29 
 
 		 665 aa  422  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  47.78 
 
 		 686 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1395  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.61 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  53.02 
 
 		 670 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  50.34 
 
 		 673 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.12 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  50.57 
 
 		 673 aa  403  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.21 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.96 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1223  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.14 
 
 		 668 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1853  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.93 
 
 		 682 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2379  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.46 
 
 		 682 aa  399  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  48.6 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06260  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.71 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1271  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.18 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.35 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  45.14 
 
 		 733 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.98 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0029  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.36 
 
 		 450 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00270537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.56 
 
 		 673 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.450975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.31 
 
 		 655 aa  396  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2167  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.54 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  44.82 
 
 		 498 aa  395  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.46 
 
 		 682 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.88 
 
 		 655 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.81 
 
 		 669 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2043  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.69 
 
 		 682 aa  396  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.11 
 
 		 669 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1600  methylcrotonyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.5 
 
 		 681 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.79 
 
 		 445 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0175  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.42 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.83 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  44.84 
 
 		 656 aa  391  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.59 
 
 		 448 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.37 
 
 		 449 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2802  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.07 
 
 		 684 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0196  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.68 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.469913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.46 
 
 		 682 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 662 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.05 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46 
 
 		 662 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0434  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.24 
 
 		 659 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0794  pyruvate carboxylase subunit A  43.74 
 
 		 499 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>