More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0606 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  40.03 
 
 		 1241 aa  881    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  56.37 
 
 		 1179 aa  1241    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  53.12 
 
 		 1209 aa  1231    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  52.28 
 
 		 1162 aa  1120    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.98 
 
 		 1220 aa  1165    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  53.26 
 
 		 1226 aa  1273    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  52.68 
 
 		 1204 aa  1244    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  57.42 
 
 		 1203 aa  1351    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  54.87 
 
 		 1179 aa  1269    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  55.9 
 
 		 1205 aa  1293    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.2 
 
 		 1205 aa  1283    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  55.48 
 
 		 1180 aa  1242    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  57.18 
 
 		 1488 aa  868    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  58.4 
 
 		 1201 aa  1342    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  56.67 
 
 		 1204 aa  1357    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  58.6 
 
 		 1233 aa  1338    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  54.89 
 
 		 1205 aa  1218    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  54.08 
 
 		 1210 aa  1272    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.23 
 
 		 1204 aa  1119    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  55.05 
 
 		 1201 aa  1268    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  52.01 
 
 		 1204 aa  1205    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  55.01 
 
 		 1179 aa  1286    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  56.71 
 
 		 1176 aa  1261    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.7 
 
 		 1206 aa  1286    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  57.05 
 
 		 1200 aa  1343    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  54.89 
 
 		 1212 aa  1360    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  56.89 
 
 		 1209 aa  1373    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  54.97 
 
 		 1205 aa  1220    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  50.49 
 
 		 1212 aa  1073    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 1197 aa  2419    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  52.6 
 
 		 1207 aa  1226    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  53.12 
 
 		 1201 aa  1207    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  56.75 
 
 		 1208 aa  1375    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  55.07 
 
 		 1200 aa  1268    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  53.44 
 
 		 1209 aa  1293    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  53.27 
 
 		 1243 aa  1279    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  56.44 
 
 		 1197 aa  1278    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  56.18 
 
 		 1183 aa  1308    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  53.89 
 
 		 1172 aa  1252    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  56.54 
 
 		 1176 aa  1259    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  56.35 
 
 		 1205 aa  1311    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  56.09 
 
 		 1228 aa  1290    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  56.3 
 
 		 1183 aa  1292    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  54.05 
 
 		 1231 aa  1262    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  53.17 
 
 		 1204 aa  1265    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  66.04 
 
 		 1238 aa  1550    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  55.56 
 
 		 677 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  55.19 
 
 		 1203 aa  1255    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51.54 
 
 		 1208 aa  1220    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  55.91 
 
 		 1205 aa  1290    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  54.89 
 
 		 1205 aa  1218    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  55.66 
 
 		 1203 aa  1318    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  53.6 
 
 		 663 aa  690    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  44.88 
 
 		 1822 aa  1082    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  55.77 
 
 		 1182 aa  1291    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  54.68 
 
 		 1234 aa  1222    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  55.91 
 
 		 1205 aa  1290    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.54 
 
 		 450 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  50.23 
 
 		 450 aa  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.49 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  50.45 
 
 		 654 aa  416  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.03 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.49 
 
 		 445 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.26 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.26 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.03 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.49 
 
 		 445 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.98 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.26 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.03 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50 
 
 		 665 aa  413  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.03 
 
 		 445 aa  410  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0175  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.2 
 
 		 449 aa  406  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.8 
 
 		 445 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.8 
 
 		 445 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.18 
 
 		 670 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.4 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.5 
 
 		 447 aa  405  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.62 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.92 
 
 		 678 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1660  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.24 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  46.17 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.9 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.72 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  47.03 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.94 
 
 		 681 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0007  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.46 
 
 		 465 aa  400  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2602  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.52 
 
 		 447 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000536628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1473  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  51.94 
 
 		 666 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50 
 
 		 660 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.11 
 
 		 662 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.18 
 
 		 448 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  47.31 
 
 		 662 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.03 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  46.53 
 
 		 686 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.79 
 
 		 449 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.31 
 
 		 662 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  48.43 
 
 		 666 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2677  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.8 
 
 		 447 aa  396  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.33 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>