286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  100 
 
 
290 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  62.01 
 
 
286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  56.23 
 
 
288 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  57.86 
 
 
308 aa  288  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  60.92 
 
 
312 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  58.78 
 
 
293 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  52.84 
 
 
300 aa  262  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  58.42 
 
 
282 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  53.02 
 
 
325 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  54.96 
 
 
285 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  52.67 
 
 
292 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  52.67 
 
 
292 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  52.67 
 
 
292 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  52.11 
 
 
298 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  53.17 
 
 
314 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  55.43 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.98 
 
 
562 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  55.48 
 
 
311 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  47.32 
 
 
549 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  48.99 
 
 
553 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  53.55 
 
 
298 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  54.74 
 
 
288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  47.73 
 
 
555 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  49.48 
 
 
539 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  46.58 
 
 
541 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  48.96 
 
 
288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  46.42 
 
 
539 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  49.3 
 
 
282 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  47.46 
 
 
531 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  46.88 
 
 
536 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  52.2 
 
 
539 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.39 
 
 
585 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  46.39 
 
 
534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  50.35 
 
 
285 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  44.84 
 
 
571 aa  201  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  46.35 
 
 
564 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  41.34 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  40.35 
 
 
310 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  41.4 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  44.13 
 
 
522 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  45.99 
 
 
510 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  41.7 
 
 
310 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  39.65 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.65 
 
 
316 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.3 
 
 
316 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  39.35 
 
 
350 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  47.6 
 
 
518 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  39.24 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  42.41 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  39.03 
 
 
350 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  41.24 
 
 
339 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  38.71 
 
 
350 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  44.37 
 
 
592 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.13 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.13 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  40.77 
 
 
344 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  39.67 
 
 
353 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  39.61 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  39.81 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  39.81 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  39.23 
 
 
355 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  39.23 
 
 
355 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  39.23 
 
 
355 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  41.16 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  40.14 
 
 
331 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 
310 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.23 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.23 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.23 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
314 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.23 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.21 
 
 
339 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  37.59 
 
 
310 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  37.59 
 
 
310 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.59 
 
 
310 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.59 
 
 
310 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  37.59 
 
 
310 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  34.58 
 
 
307 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.88 
 
 
310 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  36.64 
 
 
312 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.29 
 
 
365 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 
343 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.1 
 
 
334 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  34.8 
 
 
328 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  35.52 
 
 
328 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  38.44 
 
 
331 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 
310 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  32.65 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  36.52 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  38.72 
 
 
345 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  37.06 
 
 
323 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
339 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  32.99 
 
 
322 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  38.98 
 
 
329 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  39.3 
 
 
315 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 
326 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>