286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2934 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  100 
 
 		 324 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  95.06 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  84.47 
 
 		 323 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  83.9 
 
 		 323 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  83.59 
 
 		 323 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  81.37 
 
 		 323 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  73.27 
 
 		 325 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  71.96 
 
 		 325 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  68.87 
 
 		 331 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  68.24 
 
 		 331 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  66.46 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  67.82 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  68.14 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  67.82 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.14 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.14 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  68.14 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  68.14 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  64.58 
 
 		 325 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  65.11 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  64.8 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  63.24 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  66 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  64.01 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  61.51 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  58.92 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  46.56 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  41.56 
 
 		 1208 aa  215  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  40.68 
 
 		 1203 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  39.06 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  38.34 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.75 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.98 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  40.06 
 
 		 1201 aa  199  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  40.26 
 
 		 1207 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  39.76 
 
 		 1204 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  40 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  40 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  38.97 
 
 		 1204 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  38.62 
 
 		 1204 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  39.18 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.68 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  38.2 
 
 		 1204 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  39.87 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  38.97 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  40 
 
 		 1212 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  38.69 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.31 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  39.81 
 
 		 1200 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  37.93 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  42.05 
 
 		 1200 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  40.92 
 
 		 1201 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  33.43 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.96 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.96 
 
 		 348 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  39.81 
 
 		 1209 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  40.49 
 
 		 1228 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.58 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  37.88 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35.09 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.93 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  41.04 
 
 		 1231 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  38.17 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  39.06 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  40.51 
 
 		 1488 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.62 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.62 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.76 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.62 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.62 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  39.35 
 
 		 1209 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.62 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.17 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  38.32 
 
 		 1209 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.02 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.49 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.49 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  32.54 
 
 		 1822 aa  181  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.8 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  37.93 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  33.53 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.02 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.99 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.08 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  37.31 
 
 		 355 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>