286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0022 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  59.48 
 
 
306 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  59.48 
 
 
306 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  59.8 
 
 
306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  59.02 
 
 
306 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  48.74 
 
 
328 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  50 
 
 
310 aa  289  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  49.68 
 
 
310 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  49.68 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  49.68 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  49.68 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  49.68 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  49.68 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  50 
 
 
310 aa  285  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  49.68 
 
 
310 aa  285  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  49.19 
 
 
314 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  50 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  50 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  50 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  50 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  49.68 
 
 
309 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  49.67 
 
 
310 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  52.05 
 
 
310 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  49.68 
 
 
310 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  48.15 
 
 
310 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  49.84 
 
 
309 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  48.86 
 
 
314 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  50.82 
 
 
313 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  49.5 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  49.17 
 
 
316 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  49.17 
 
 
316 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  45.05 
 
 
356 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  45.05 
 
 
356 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  42.27 
 
 
350 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  42.01 
 
 
350 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  46.27 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  42.01 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  46.27 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  44.91 
 
 
355 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  44.91 
 
 
355 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  44.91 
 
 
355 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  44.51 
 
 
339 aa  244  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  45.34 
 
 
353 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  44.31 
 
 
359 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  44.31 
 
 
359 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  44.31 
 
 
359 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  44.31 
 
 
371 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  44.31 
 
 
371 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  44.31 
 
 
371 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  45.45 
 
 
339 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  44.31 
 
 
371 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  44.11 
 
 
355 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  46.45 
 
 
359 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  46.08 
 
 
355 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  41.95 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  45.2 
 
 
332 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  41.99 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  39.42 
 
 
319 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  43.56 
 
 
330 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  40.94 
 
 
323 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  40.79 
 
 
332 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  40.85 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  39.49 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  41.49 
 
 
329 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  39.22 
 
 
331 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  39.26 
 
 
309 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  39.35 
 
 
317 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  40.2 
 
 
323 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  38.39 
 
 
365 aa  192  8e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  41.7 
 
 
290 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  43.92 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.23 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  40.5 
 
 
338 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  39.27 
 
 
312 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  41.3 
 
 
288 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.53 
 
 
328 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  39.94 
 
 
331 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  40.13 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  37.01 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  39.26 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  40.69 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  40.54 
 
 
318 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  38.98 
 
 
331 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  36.62 
 
 
325 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  38.3 
 
 
344 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  39.93 
 
 
308 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  38.31 
 
 
311 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  37.7 
 
 
1208 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  35.18 
 
 
329 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  39.93 
 
 
315 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.39 
 
 
329 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  43.15 
 
 
312 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  37.94 
 
 
354 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  36.02 
 
 
315 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.94 
 
 
354 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1802  allophanate hydrolase subunit 2  42.12 
 
 
324 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.560779  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  41.14 
 
 
334 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  41.14 
 
 
334 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  41.14 
 
 
334 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  41.14 
 
 
334 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>