286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0599 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  76.88 
 
 		 325 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  74.45 
 
 		 323 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  74.21 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  74.13 
 
 		 323 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  73.27 
 
 		 324 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  74.2 
 
 		 323 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  72.33 
 
 		 324 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  70.53 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  67.92 
 
 		 335 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  68.87 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.87 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.55 
 
 		 334 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  68.87 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  68.87 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.24 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  68.24 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  67.2 
 
 		 331 aa  427  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  67.2 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  66.15 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  65.52 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  64.47 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  63.01 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  60.31 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  59.25 
 
 		 323 aa  358  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  56.43 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  48.28 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  42.86 
 
 		 1208 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  42.04 
 
 		 1204 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  41.64 
 
 		 1209 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.58 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  40.49 
 
 		 1212 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  41.9 
 
 		 1207 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  39.49 
 
 		 1204 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  39.76 
 
 		 1209 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.94 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  36.47 
 
 		 1822 aa  200  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  39.5 
 
 		 1204 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  42.62 
 
 		 1203 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  37.19 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  37.19 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  35.94 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  36.56 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.62 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  40.44 
 
 		 1203 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  36.56 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  36.25 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.62 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35.62 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  39.82 
 
 		 1209 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  39.81 
 
 		 1204 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.05 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  40.98 
 
 		 1201 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  40.62 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  40.58 
 
 		 1200 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  40.65 
 
 		 1231 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  40.58 
 
 		 1488 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  40.75 
 
 		 1228 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  42.43 
 
 		 1200 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  39.33 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  37.24 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  39.76 
 
 		 1233 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.11 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.73 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  39.38 
 
 		 1201 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  38.55 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  40.58 
 
 		 1210 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  39.55 
 
 		 1226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  40.97 
 
 		 1197 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  38.17 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  35.71 
 
 		 1206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.65 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  38.71 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  38.71 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.91 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  38.71 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.65 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  38.71 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  38.71 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  38.71 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  38.71 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  39.81 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  40.26 
 
 		 1238 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.34 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  40.75 
 
 		 1197 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.12 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.81 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.81 
 
 		 348 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  32.5 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  38.11 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  38.42 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.65 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>