286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1973 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  99.14 
 
 
349 aa  698    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  100 
 
 
348 aa  705    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  85.84 
 
 
353 aa  597  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  63.4 
 
 
339 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  62.9 
 
 
339 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  54.23 
 
 
350 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  54.73 
 
 
355 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  54.73 
 
 
355 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  54.73 
 
 
355 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  53.55 
 
 
350 aa  331  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  53.35 
 
 
371 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  53.35 
 
 
371 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  53.35 
 
 
371 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  53.35 
 
 
371 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  54.39 
 
 
359 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  54.39 
 
 
359 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  53.57 
 
 
350 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  54.39 
 
 
359 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  54.55 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  54.71 
 
 
359 aa  325  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  54.33 
 
 
356 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  53.73 
 
 
356 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  54.71 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  51.23 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  51.74 
 
 
310 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  51.42 
 
 
310 aa  302  7.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  51.42 
 
 
310 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  51.42 
 
 
310 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  51.42 
 
 
310 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  51.42 
 
 
310 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  51.42 
 
 
310 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  51.42 
 
 
310 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  51.55 
 
 
316 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  51.55 
 
 
316 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  51.1 
 
 
310 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  50.15 
 
 
310 aa  298  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  50.47 
 
 
309 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  51.24 
 
 
316 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  51.72 
 
 
310 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  51.72 
 
 
310 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  50.91 
 
 
332 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  51.72 
 
 
310 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  51.72 
 
 
310 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  51.72 
 
 
310 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  48.91 
 
 
314 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  48.76 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  47.98 
 
 
314 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  51.21 
 
 
329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  45.65 
 
 
332 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  44.79 
 
 
326 aa  262  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  45.45 
 
 
331 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  45.14 
 
 
331 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  46.27 
 
 
310 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  48.36 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  45.72 
 
 
334 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  44.65 
 
 
323 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  47.35 
 
 
330 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  42.41 
 
 
319 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  41.49 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  38.79 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  39.37 
 
 
389 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  42.9 
 
 
318 aa  228  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  39.03 
 
 
329 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  38.24 
 
 
328 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  42.81 
 
 
307 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  40.48 
 
 
328 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  40.36 
 
 
323 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  41.32 
 
 
309 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  39.23 
 
 
329 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  38.71 
 
 
329 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  38.91 
 
 
329 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  39.23 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  39.23 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  38.71 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  38.64 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  38.39 
 
 
329 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  39.16 
 
 
329 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  43.42 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.06 
 
 
330 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.85 
 
 
334 aa  212  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  37.42 
 
 
343 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  39.1 
 
 
354 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  38.18 
 
 
325 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  39.1 
 
 
354 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.77 
 
 
365 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  41.36 
 
 
336 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  41.91 
 
 
339 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  37.85 
 
 
309 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  40.68 
 
 
306 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  40.68 
 
 
306 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  40.68 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  37.65 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0989  allophanate hydrolase subunit 2  37.85 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00574869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  41.58 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  40.25 
 
 
306 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  35.76 
 
 
321 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  39.64 
 
 
349 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  38.06 
 
 
353 aa  193  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 
311 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  35.43 
 
 
321 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>