286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1168 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  99.37 
 
 		 316 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 316 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  99.37 
 
 		 316 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  76.62 
 
 		 310 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  68.51 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  68.51 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  68.51 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  68.18 
 
 		 310 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  68.51 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  68.51 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  68.51 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  68.51 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  69.06 
 
 		 310 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  69.06 
 
 		 310 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  68.73 
 
 		 310 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  68.73 
 
 		 310 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  68.18 
 
 		 310 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  69.06 
 
 		 310 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  69.23 
 
 		 314 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  69.23 
 
 		 314 aa  434  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  69.06 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  68.54 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  66.12 
 
 		 310 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  47.43 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  51.55 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  51.55 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  49.38 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  46.22 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  45.02 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  46.85 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  46.85 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  46.85 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  46.85 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  46.85 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  46.85 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  46.85 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  47.29 
 
 		 355 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  47.29 
 
 		 355 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  47.29 
 
 		 355 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  46.71 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  47.11 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  46.81 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  48.34 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  46.08 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  47.16 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  46.85 
 
 		 359 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  47.48 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  49.5 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  46.86 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  45.71 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  45.03 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  44.06 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  42.72 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  43.23 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  43.89 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  40.19 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  43.83 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  43.79 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  43 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  43.79 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  43.79 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  43.32 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  40.57 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  42.09 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  40.26 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  39.31 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  43.23 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  42.32 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  41.64 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  39.54 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.44 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.64 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.94 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.94 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40.46 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.46 
 
 		 365 aa  198  7.999999999999999e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.24 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.94 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.64 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  40 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  40.32 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.92 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.92 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  40 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  38.75 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  40 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  38.36 
 
 		 354 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  38.65 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  36.14 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  39.68 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  39.65 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  38.1 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  37.67 
 
 		 354 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  38.03 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  37.96 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.66 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  36.48 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  41.84 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.41 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>