286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3742 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  100 
 
 
350 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  97.71 
 
 
350 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  87.14 
 
 
350 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  74.26 
 
 
355 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  74.26 
 
 
355 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  72.78 
 
 
359 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  74.26 
 
 
355 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  74.77 
 
 
356 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  74.26 
 
 
355 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  71.59 
 
 
371 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  74.17 
 
 
356 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  72.49 
 
 
359 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  72.49 
 
 
359 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  71.59 
 
 
371 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  71.59 
 
 
371 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  71.59 
 
 
371 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  74.85 
 
 
355 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  71.89 
 
 
359 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  55.06 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  53.57 
 
 
348 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  53.57 
 
 
349 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  52.98 
 
 
339 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  49.55 
 
 
310 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  51.61 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  50 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  49.39 
 
 
309 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  46.22 
 
 
316 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  46.22 
 
 
316 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  45.92 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  45.97 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  46.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  45.15 
 
 
310 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  45.15 
 
 
310 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  45.15 
 
 
310 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  45.15 
 
 
310 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  45.15 
 
 
310 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  44.78 
 
 
314 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  45.13 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  44.54 
 
 
310 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  44.54 
 
 
310 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  44.54 
 
 
310 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  44.54 
 
 
310 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  44.54 
 
 
310 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  44.84 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  44.54 
 
 
310 aa  269  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  46.25 
 
 
323 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  44.54 
 
 
310 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  44.24 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  47.89 
 
 
329 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  41.43 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  42.01 
 
 
310 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  40 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  42.9 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  41.82 
 
 
331 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  40.6 
 
 
326 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  45.45 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  38.9 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  43.9 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  41.89 
 
 
323 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  39.52 
 
 
310 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  42.69 
 
 
334 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
319 aa  225  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  40.18 
 
 
309 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  38.58 
 
 
329 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  37.2 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  38.32 
 
 
306 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  38.32 
 
 
306 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  38.32 
 
 
306 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  38.3 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  37.58 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  38.02 
 
 
306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  36.2 
 
 
329 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  37.72 
 
 
334 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.91 
 
 
329 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.53 
 
 
330 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  36.31 
 
 
329 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  35.06 
 
 
329 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40.24 
 
 
315 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.91 
 
 
329 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  41.71 
 
 
318 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.42 
 
 
329 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  36.5 
 
 
320 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  36.5 
 
 
320 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.65 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  39.02 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  38.14 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  38.71 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  37.39 
 
 
323 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  36.34 
 
 
311 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  37.88 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  37.1 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  37.24 
 
 
324 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  38.08 
 
 
334 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  38.27 
 
 
334 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.08 
 
 
334 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.27 
 
 
334 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  38.08 
 
 
334 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  38.08 
 
 
334 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.27 
 
 
334 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  37.79 
 
 
325 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>