286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4553 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  100 
 
 
331 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  90.03 
 
 
331 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  59.39 
 
 
332 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  54.26 
 
 
326 aa  346  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  46.33 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  47.71 
 
 
330 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  47.52 
 
 
334 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  47.48 
 
 
323 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  47.35 
 
 
329 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  45.14 
 
 
349 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  45.14 
 
 
348 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  42.86 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  42.12 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  42.45 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  41.82 
 
 
356 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  40.48 
 
 
350 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  46.39 
 
 
339 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  41.28 
 
 
355 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  41.28 
 
 
355 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  41.28 
 
 
355 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  42.9 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  43.22 
 
 
350 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  42.77 
 
 
310 aa  238  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  40.84 
 
 
355 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  42.39 
 
 
355 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  40.17 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  40.17 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  40.17 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  40.17 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  40.68 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  41.32 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  41.32 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  41.32 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  41.19 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  41.19 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  41.19 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  41.32 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  41.32 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  41.32 
 
 
310 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  45.48 
 
 
339 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  41.82 
 
 
309 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  41.32 
 
 
310 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  41.32 
 
 
310 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  40.57 
 
 
316 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
314 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  40.57 
 
 
316 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  41.01 
 
 
310 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  40.25 
 
 
316 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  40.38 
 
 
310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  41.32 
 
 
359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  39.75 
 
 
310 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  39.75 
 
 
310 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  39.75 
 
 
310 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  39.75 
 
 
310 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  40.43 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  39.43 
 
 
310 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  39.18 
 
 
319 aa  215  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  38.87 
 
 
309 aa  208  8e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  39.49 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  40.37 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  36.98 
 
 
310 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  35.22 
 
 
307 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40.98 
 
 
315 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.99 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  35.35 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35.92 
 
 
329 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  35.06 
 
 
329 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.27 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.6 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  38.29 
 
 
318 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.96 
 
 
343 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  35.35 
 
 
329 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.13 
 
 
329 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  37.11 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  34.91 
 
 
328 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.27 
 
 
329 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  38.18 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  34.06 
 
 
320 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  34.06 
 
 
320 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.25 
 
 
325 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.85 
 
 
334 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.38 
 
 
365 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  36.34 
 
 
331 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  35.87 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  35.35 
 
 
353 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  35.98 
 
 
325 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  40.14 
 
 
290 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 
306 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 
306 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  34.62 
 
 
313 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.66 
 
 
317 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  39.69 
 
 
344 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  35.93 
 
 
306 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  35.93 
 
 
306 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  35.49 
 
 
324 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  35.91 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.22 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.57 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>